265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2130 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
282 aa  577  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  60.15 
 
 
284 aa  319  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  54.3 
 
 
276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  36.16 
 
 
287 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03884  hypothetical protein  46.6 
 
 
136 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.762573 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
262 aa  92.8  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 
269 aa  89.7  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  25.85 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 
235 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  25.85 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  24.15 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  24.15 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  24.15 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  24.15 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  24.17 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  27.37 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0714  hypothetical protein  23.91 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  29.56 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_003296  RS03883  hypothetical protein  32.69 
 
 
216 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 
302 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4355  beta-lactamase domain protein  28.96 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.112156  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  27.2 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  27.9 
 
 
238 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  28.03 
 
 
287 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  28.37 
 
 
326 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 
324 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3000  hypothetical protein  28.03 
 
 
282 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3246  hypothetical protein  28.03 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002733  GumP protein  30.95 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672439  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 
262 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3015  hypothetical protein  26.73 
 
 
287 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3247  hypothetical protein  26.73 
 
 
283 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  32.59 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.94 
 
 
266 aa  59.7  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2956  beta-lactamase domain-containing protein  28.03 
 
 
283 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0379847  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 
233 aa  59.3  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 
329 aa  59.3  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  24.89 
 
 
278 aa  58.9  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  29.57 
 
 
198 aa  58.9  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 
302 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  25.89 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  27.27 
 
 
297 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  26.36 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  24.51 
 
 
249 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  26.4 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4648  beta-lactamase domain protein  24.03 
 
 
280 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197699  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2102  hypothetical protein  28.22 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  29.47 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 
324 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 
298 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  29.05 
 
 
322 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  29.55 
 
 
284 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  27.07 
 
 
302 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 
302 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 
320 aa  56.6  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  30.5 
 
 
315 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  25.24 
 
 
327 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 
329 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  27.43 
 
 
332 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  26.37 
 
 
329 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  31.1 
 
 
263 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0157  metallo-beta-lactamase family protein  28.07 
 
 
312 aa  56.2  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.233934  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  24.67 
 
 
321 aa  55.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2721  beta-lactamase domain protein  25.42 
 
 
268 aa  56.2  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.91537  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1468  beta-lactamase domain-containing protein  26.14 
 
 
271 aa  55.8  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  27.07 
 
 
339 aa  55.8  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  28.65 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  27.51 
 
 
351 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  26.59 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0375  beta-lactamase domain-containing protein  23.77 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  24.29 
 
 
327 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  26.09 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.17 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  29.61 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  29.63 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  28.26 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  25.47 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02639  conserved hypothetical protein  30 
 
 
365 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.453021 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  28.79 
 
 
284 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  28.79 
 
 
284 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  28.79 
 
 
284 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1316  beta-lactamase domain protein  28.26 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  26.28 
 
 
335 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  28.79 
 
 
284 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  25.82 
 
 
321 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  29.88 
 
 
324 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  28.49 
 
 
322 aa  53.1  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4058  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 
258 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2345  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 
261 aa  53.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000431661  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  28.37 
 
 
238 aa  52.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  26.05 
 
 
276 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>