154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2102 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2102  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  97.92 
 
 
288 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4355  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.112156  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  28.98 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3015  hypothetical protein  25.82 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  26.18 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3247  hypothetical protein  25.82 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0671  beta-lactamase domain-containing protein  32.51 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275685  normal  0.315367 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3246  hypothetical protein  26.18 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3335  beta-lactamase domain-containing protein  25.15 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.593309  normal  0.179661 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2956  beta-lactamase domain-containing protein  26.05 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0379847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3000  hypothetical protein  26.14 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0375  beta-lactamase domain-containing protein  27.94 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1675  beta-lactamase domain-containing protein  30.49 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07316  conserved hypothetical protein  28 
 
 
294 aa  67  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000551538  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  33.17 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3173  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  22.06 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0714  hypothetical protein  25.52 
 
 
279 aa  63.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4140  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 
268 aa  62.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4421  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 
268 aa  62.8  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0101  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149463  hitchhiker  0.000938993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  29.19 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5177  hypothetical protein  27.65 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  hitchhiker  0.00169799 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12323  hypothetical protein  31.79 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2345  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000431661  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18590  metallo-beta-lactamase superfamily enzyme  26.12 
 
 
282 aa  60.1  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.344551  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08635  conserved hypothetical protein  24.48 
 
 
317 aa  58.9  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.19369 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1468  beta-lactamase domain-containing protein  28.33 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  28.22 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2721  beta-lactamase domain protein  31.22 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.91537  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5078  beta-lactamase domain-containing protein  30.34 
 
 
264 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  22.13 
 
 
261 aa  57.4  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2106  metallo-beta-lactamase family protein  29.48 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2215  beta-lactamase domain-containing protein  29.48 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4648  beta-lactamase domain protein  26.57 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197699  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  27.95 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.03 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002733  GumP protein  23.46 
 
 
287 aa  53.5  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 
249 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  29.15 
 
 
328 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  24.58 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  33.59 
 
 
211 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  26.87 
 
 
329 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  27.72 
 
 
215 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  26.21 
 
 
278 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  26.21 
 
 
278 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  26.21 
 
 
278 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  25.52 
 
 
266 aa  49.7  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2867  beta-lactamase domain-containing protein  26.96 
 
 
268 aa  49.7  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.407277  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  27.17 
 
 
215 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  25.47 
 
 
230 aa  49.3  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 
233 aa  49.3  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 
226 aa  49.3  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  27.42 
 
 
214 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.57 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0157  metallo-beta-lactamase family protein  29.37 
 
 
312 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.233934  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 
214 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  25.58 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.57 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  25.58 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.57 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.57 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.57 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  33.33 
 
 
238 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 
214 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  25.15 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1798  beta-lactamase-like  27.38 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  27.42 
 
 
214 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 
245 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  26.63 
 
 
215 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  26.63 
 
 
215 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  27.01 
 
 
215 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 
215 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 
281 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 
215 aa  46.6  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  35.61 
 
 
292 aa  46.6  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  33.06 
 
 
281 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  26.63 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  33.06 
 
 
281 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
215 aa  46.2  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 
206 aa  46.2  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  27.87 
 
 
326 aa  46.2  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  26.63 
 
 
215 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  26.63 
 
 
215 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03884  hypothetical protein  28.15 
 
 
136 aa  46.2  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.762573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  30.33 
 
 
296 aa  46.2  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  26.63 
 
 
215 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 
215 aa  45.8  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
205 aa  45.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1316  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 
263 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>