107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4140 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4140  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 268 aa  555  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4421  beta-lactamase domain protein  95.52 
 
 		 268 aa  534  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2867  beta-lactamase domain-containing protein  65.67 
 
 		 268 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.407277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2215  beta-lactamase domain-containing protein  63.81 
 
 		 268 aa  368  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2106  metallo-beta-lactamase family protein  63.43 
 
 		 268 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  35.96 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3246  hypothetical protein  35.96 
 
 		 283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3015  hypothetical protein  35.21 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3247  hypothetical protein  35.21 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3000  hypothetical protein  35.58 
 
 		 282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2956  beta-lactamase domain-containing protein  35.21 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0379847  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  34.38 
 
 		 278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002733  GumP protein  33.99 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0375  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 		 271 aa  118  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0671  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275685  normal  0.315367 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3111  beta-lactamase domain protein  27.2 
 
 		 268 aa  85.9  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4058  beta-lactamase domain protein  28.08 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966002  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0714  hypothetical protein  26.74 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5078  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2102  hypothetical protein  27.63 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1468  beta-lactamase domain-containing protein  26.56 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  27.34 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12323  hypothetical protein  28.95 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  24.76 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  25.6 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1675  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  23.81 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  23.81 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  23.81 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  24.64 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  23.33 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0101  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149463  hitchhiker  0.000938993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3685  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265853  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4648  beta-lactamase domain protein  29.02 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197699  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2345  beta-lactamase domain protein  25.98 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000431661  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  30.99 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  22.61 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  30.28 
 
 		 287 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  35.54 
 
 		 279 aa  52  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  23 
 
 		 299 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  23.67 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0111  hypothetical protein  39.13 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  23.27 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3173  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  22.9 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  28.37 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  28 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  27.32 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  24.32 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4355  beta-lactamase domain protein  31.62 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.112156  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  27.46 
 
 		 283 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  28.23 
 
 		 296 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  24.44 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  26.21 
 
 		 324 aa  45.8  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  27.33 
 
 		 327 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  28.06 
 
 		 237 aa  45.8  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00028  conserved hypothetical protein  25.65 
 
 		 359 aa  45.4  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.531794  normal  0.132381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 332 aa  45.4  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  25.32 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  25 
 
 		 329 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  24.41 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  24.49 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  39.47 
 
 		 322 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  24.43 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  28.92 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  25 
 
 		 332 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.32 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  28.21 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  28.21 
 
 		 311 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.37 
 
 		 312 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  25.62 
 
 		 332 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3335  beta-lactamase domain-containing protein  23.47 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.593309  normal  0.179661 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  28.21 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  28.21 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  28.21 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  28.21 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  29.69 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 		 324 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3467  metal dependent hydrolase  30 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  28.21 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  24.44 
 
 		 330 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  27.22 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  31.54 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  30.39 
 
 		 305 aa  43.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  32.06 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  20.98 
 
 		 295 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  26 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  27.35 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5177  hypothetical protein  24.86 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  hitchhiker  0.00169799 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>