126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0714 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0714  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  569  1e-161  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18590  metallo-beta-lactamase superfamily enzyme  28.21 
 
 
282 aa  90.1  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.344551  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  30.87 
 
 
302 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  29.15 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  29.15 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  29.15 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  29.15 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  26.75 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  29.78 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  29.02 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  28.7 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1468  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3000  hypothetical protein  27.95 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  27.17 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002733  GumP protein  26.09 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672439  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  27.35 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3246  hypothetical protein  27.56 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4140  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3015  hypothetical protein  26.09 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3247  hypothetical protein  26.09 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  23.91 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2956  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0379847  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4421  beta-lactamase domain protein  27.34 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2867  beta-lactamase domain-containing protein  26.03 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.407277  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2345  beta-lactamase domain protein  31.19 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000431661  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  24.31 
 
 
287 aa  63.9  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  27.65 
 
 
262 aa  63.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2102  hypothetical protein  25.52 
 
 
288 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  23.14 
 
 
284 aa  63.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  23.67 
 
 
288 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  27.42 
 
 
289 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  27.95 
 
 
282 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2106  metallo-beta-lactamase family protein  24.21 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2215  beta-lactamase domain-containing protein  25.7 
 
 
268 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12323  hypothetical protein  28.51 
 
 
310 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 
253 aa  59.3  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 
198 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0101  beta-lactamase domain-containing protein  29.05 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149463  hitchhiker  0.000938993 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  23.29 
 
 
261 aa  55.8  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  23.5 
 
 
282 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3173  beta-lactamase domain protein  26.76 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.28 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  25.61 
 
 
249 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  26.55 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5177  hypothetical protein  37.9 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  hitchhiker  0.00169799 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4355  beta-lactamase domain protein  25.76 
 
 
310 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.112156  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  25.41 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4058  beta-lactamase domain protein  31.41 
 
 
258 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966002  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  27 
 
 
288 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  28.14 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  23.89 
 
 
276 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  23.87 
 
 
299 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 
233 aa  52.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3366  beta-lactamase domain protein  27.89 
 
 
210 aa  52.4  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  25.43 
 
 
327 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  29.19 
 
 
238 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0671  beta-lactamase domain-containing protein  27.12 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275685  normal  0.315367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 
293 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  23.75 
 
 
301 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0375  beta-lactamase domain-containing protein  24.14 
 
 
271 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5078  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1675  beta-lactamase domain-containing protein  28.27 
 
 
267 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 
262 aa  49.3  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 
293 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  24.15 
 
 
297 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  27.4 
 
 
243 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  23.12 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  23.86 
 
 
230 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  24.53 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  25.1 
 
 
321 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  24.53 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07316  conserved hypothetical protein  34.04 
 
 
294 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000551538  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2378  beta-lactamase-like protein  23.53 
 
 
271 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  21 
 
 
235 aa  46.6  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  25 
 
 
329 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  24.38 
 
 
285 aa  46.6  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  31.78 
 
 
307 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0756  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 
291 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.401313  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  22.63 
 
 
279 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  24.47 
 
 
295 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3685  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265853  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  22.49 
 
 
297 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  27.75 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  25.77 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.42 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  27.32 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  22.61 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
240 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  23.7 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4648  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197699  normal  0.411679 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>