50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2215 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2215  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 268 aa  557  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2106  metallo-beta-lactamase family protein  99.63 
 
 		 268 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2867  beta-lactamase domain-containing protein  72.39 
 
 		 268 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.407277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4140  beta-lactamase domain protein  63.81 
 
 		 268 aa  368  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4421  beta-lactamase domain protein  61.57 
 
 		 268 aa  353  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  37.94 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  34.11 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3000  hypothetical protein  33.46 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2956  beta-lactamase domain-containing protein  33.98 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0379847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3246  hypothetical protein  33.72 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3015  hypothetical protein  32.95 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3247  hypothetical protein  32.95 
 
 		 283 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002733  GumP protein  30.19 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0375  beta-lactamase domain-containing protein  32.68 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3111  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229878  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0671  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275685  normal  0.315367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4058  beta-lactamase domain protein  26.82 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5078  beta-lactamase domain-containing protein  25.19 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5252  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2345  beta-lactamase domain protein  23.77 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000431661  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0714  hypothetical protein  25.7 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0101  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149463  hitchhiker  0.000938993 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12323  hypothetical protein  26.49 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1675  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1468  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2102  hypothetical protein  29.48 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  29.48 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3685  beta-lactamase domain-containing protein  23.77 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265853  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3173  beta-lactamase domain protein  25.28 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  22.5 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  25.42 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  25.14 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  24.29 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00028  conserved hypothetical protein  27.98 
 
 		 359 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.531794  normal  0.132381 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  29.37 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  21.3 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4355  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 		 310 aa  45.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.112156  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18590  metallo-beta-lactamase superfamily enzyme  23.39 
 
 		 282 aa  45.4  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.344551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  26.22 
 
 		 330 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  23.3 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  25 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  30.08 
 
 		 279 aa  42.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  23.74 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  27.83 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  27.83 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  27.83 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  23.3 
 
 		 250 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  23.3 
 
 		 250 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  23.3 
 
 		 250 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5177  hypothetical protein  22.92 
 
 		 266 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  hitchhiker  0.00169799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>