40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0671 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0671  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 260 aa  505  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275685  normal  0.315367 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  35.17 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  29.71 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3000  hypothetical protein  29.35 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3015  hypothetical protein  28.78 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3247  hypothetical protein  28.99 
 
 		 283 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3246  hypothetical protein  28.99 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2956  beta-lactamase domain-containing protein  29.29 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0379847  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002733  GumP protein  28.62 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0375  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4140  beta-lactamase domain protein  32.68 
 
 		 268 aa  95.9  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4421  beta-lactamase domain protein  32.68 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2106  metallo-beta-lactamase family protein  32.3 
 
 		 268 aa  92  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2215  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 		 268 aa  92  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2867  beta-lactamase domain-containing protein  30.35 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.407277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  31.56 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2102  hypothetical protein  32.51 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3111  beta-lactamase domain protein  24.6 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229878  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0714  hypothetical protein  27.54 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1468  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  24.14 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12323  hypothetical protein  29.88 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2345  beta-lactamase domain protein  29.24 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000431661  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4355  beta-lactamase domain protein  30.51 
 
 		 310 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.112156  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1675  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.266224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  27.22 
 
 		 314 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  27.22 
 
 		 314 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5078  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  29.95 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  25.88 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  27.33 
 
 		 393 aa  43.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  40.3 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0157  metallo-beta-lactamase family protein  27.22 
 
 		 312 aa  43.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.233934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  35.44 
 
 		 332 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  27.47 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  24.85 
 
 		 321 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  38.03 
 
 		 329 aa  42.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>