69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0157 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0157  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
312 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.233934  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4355  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.112156  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  23.5 
 
 
278 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  28.07 
 
 
282 aa  55.8  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 
243 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  27.85 
 
 
261 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  30.52 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  33.54 
 
 
369 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18590  metallo-beta-lactamase superfamily enzyme  24.64 
 
 
282 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.344551  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  32.48 
 
 
283 aa  49.3  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  27.61 
 
 
240 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  28.36 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 
324 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2102  hypothetical protein  29.37 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  28.36 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  28.02 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  28.68 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  25 
 
 
299 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  30.88 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  27.61 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  29.37 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  28.68 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  27.61 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  30.72 
 
 
198 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  32.28 
 
 
296 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  31.06 
 
 
207 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3335  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 
311 aa  46.2  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.593309  normal  0.179661 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  27.61 
 
 
240 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.45 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  29.61 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0773  beta-lactamase domain protein  32 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000303439 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3534  beta-lactamase domain protein  27.22 
 
 
264 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1046  Rhodanese domain protein  33.04 
 
 
391 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  28 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0746  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.04 
 
 
251 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.966571 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 
211 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0522  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.15 
 
 
232 aa  44.3  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  24.29 
 
 
262 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.78 
 
 
471 aa  43.9  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  34.91 
 
 
210 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 
332 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  25.1 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  25.16 
 
 
206 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
382 aa  43.5  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 
215 aa  43.5  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.49 
 
 
215 aa  43.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08635  conserved hypothetical protein  25.76 
 
 
317 aa  43.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.19369 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07316  conserved hypothetical protein  24.77 
 
 
294 aa  43.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000551538  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05621  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  32.73 
 
 
253 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0671  beta-lactamase domain-containing protein  27.22 
 
 
260 aa  43.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275685  normal  0.315367 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3366  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 
210 aa  42.7  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  24.37 
 
 
285 aa  42.7  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 
279 aa  42.7  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 
215 aa  42.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  29.49 
 
 
215 aa  42.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  29.27 
 
 
339 aa  42.7  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  25.16 
 
 
206 aa  42.7  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  28.1 
 
 
238 aa  42.7  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.63 
 
 
222 aa  42.7  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.25 
 
 
259 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  25.15 
 
 
292 aa  42.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  29.3 
 
 
209 aa  42.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1399  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 
230 aa  42.4  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.290066 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  28.81 
 
 
279 aa  42.4  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>