225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1858 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  60.15 
 
 
282 aa  319  3e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  54.58 
 
 
276 aa  275  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  36.78 
 
 
287 aa  176  5e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  35.44 
 
 
299 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03884  hypothetical protein  45.54 
 
 
136 aa  93.2  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.762573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  27.87 
 
 
250 aa  89  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  27.35 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  27.92 
 
 
250 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  27.5 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  30.57 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  25.83 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  25.82 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  26.86 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  25.83 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  25.83 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03883  hypothetical protein  35.57 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.804009 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  25.9 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  29.23 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  29.33 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  24.26 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  35.61 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  26.84 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  24.6 
 
 
282 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 
288 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3246  hypothetical protein  26.84 
 
 
283 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3000  hypothetical protein  26.84 
 
 
282 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2956  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
283 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0379847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3015  hypothetical protein  26.32 
 
 
287 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  27.81 
 
 
285 aa  62.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0714  hypothetical protein  23.53 
 
 
279 aa  62.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3247  hypothetical protein  26.32 
 
 
283 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  25.54 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  29.06 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  31.07 
 
 
291 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  26.43 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  32.55 
 
 
243 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3485  AHL-lactonase  37.5 
 
 
94 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  30.7 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  31.29 
 
 
198 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1468  beta-lactamase domain-containing protein  25.2 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  28.7 
 
 
332 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  29.14 
 
 
237 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3173  beta-lactamase domain protein  25.83 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002733  GumP protein  30.66 
 
 
287 aa  56.2  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672439  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 
301 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02639  conserved hypothetical protein  30.2 
 
 
365 aa  55.5  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.453021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3006  metal-dependent hydrolase  30.49 
 
 
312 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  28.4 
 
 
288 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.4 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2102  hypothetical protein  27.95 
 
 
288 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  29.68 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  25.33 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  27.78 
 
 
238 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2721  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 
268 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.91537  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  24.77 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  31.82 
 
 
266 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  31.05 
 
 
315 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  29.18 
 
 
325 aa  52.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.8 
 
 
293 aa  52.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08635  conserved hypothetical protein  24.73 
 
 
317 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.19369 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0157  metallo-beta-lactamase family protein  30.52 
 
 
312 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.233934  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.23 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4355  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.112156  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2867  beta-lactamase domain-containing protein  24.57 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.407277  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  26.1 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  26.57 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  29.68 
 
 
314 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  27.83 
 
 
297 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  31.85 
 
 
297 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2866  beta-lactamase domain-containing protein  29.47 
 
 
298 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 
279 aa  50.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 
318 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  26.37 
 
 
292 aa  50.1  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2378  beta-lactamase-like protein  25.71 
 
 
271 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1851  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 
335 aa  49.7  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  24.54 
 
 
226 aa  49.7  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  28.49 
 
 
294 aa  49.7  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  28.5 
 
 
328 aa  49.3  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  26.91 
 
 
252 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  29.08 
 
 
302 aa  48.9  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 
248 aa  48.9  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  27.4 
 
 
292 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  26.73 
 
 
231 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  27.47 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  27.01 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  27.93 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.94 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  27.93 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  31.72 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>