More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1544 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
294 aa  599  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  47.24 
 
 
291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  47.74 
 
 
295 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  40.54 
 
 
287 aa  209  7e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  36.59 
 
 
231 aa  95.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  35.62 
 
 
231 aa  88.6  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  36.99 
 
 
214 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  32.92 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  28.25 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  33.15 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  31.02 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  35.23 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 
234 aa  79  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  28.28 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  34.97 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  30.17 
 
 
232 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  36.84 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  36.21 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  33.09 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  32.65 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  33.83 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  39.1 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  32 
 
 
214 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  31.78 
 
 
210 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 
210 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  30.12 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  35.26 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  28.81 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  26.88 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  33.83 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  36.52 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  33.62 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 
208 aa  65.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 
205 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.79 
 
 
205 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 
214 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  25.74 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  26.43 
 
 
324 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  30.08 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  30.33 
 
 
217 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.79 
 
 
214 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  29.03 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  32.79 
 
 
214 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  31.9 
 
 
209 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  30.08 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  32.79 
 
 
214 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  32.79 
 
 
214 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 
214 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  33.86 
 
 
214 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  32.79 
 
 
214 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  32.79 
 
 
214 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  32.79 
 
 
214 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 
208 aa  63.5  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  28.32 
 
 
285 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  28.32 
 
 
285 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  35.34 
 
 
202 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  32.74 
 
 
208 aa  63.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  28.9 
 
 
323 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 
209 aa  63.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  32 
 
 
198 aa  63.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 
334 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  26.6 
 
 
348 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  33.33 
 
 
294 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 
216 aa  63.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
214 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  30.47 
 
 
214 aa  62.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 
200 aa  62.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 
202 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 
214 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.36 
 
 
207 aa  62.8  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  34.02 
 
 
288 aa  62.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 
241 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  28.81 
 
 
317 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
214 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 
242 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  31.34 
 
 
205 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  28.95 
 
 
218 aa  62  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 
246 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  33.06 
 
 
207 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  28.81 
 
 
317 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  26.11 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  36.62 
 
 
206 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  28.81 
 
 
317 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  33.33 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
214 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0773  beta-lactamase domain protein  26.26 
 
 
320 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000303439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>