More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0646 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
226 aa  457  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  50.67 
 
 
231 aa  227  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  49.33 
 
 
231 aa  211  5.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  34.08 
 
 
240 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  32.72 
 
 
241 aa  95.1  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
243 aa  92.4  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  33.04 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  32 
 
 
240 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  31.07 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  31.5 
 
 
240 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  31.55 
 
 
240 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  31 
 
 
240 aa  89  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  31.5 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  31.5 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  31.75 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  31.07 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 
294 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  30.49 
 
 
321 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  33.83 
 
 
239 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  35.37 
 
 
200 aa  86.3  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  34.1 
 
 
214 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 
200 aa  86.3  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 
223 aa  84.7  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  32.92 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  31.5 
 
 
213 aa  82  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  29.18 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  29.18 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  28.05 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  28.82 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  28.76 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  32.69 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  34.32 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  29.18 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  28.77 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  27.09 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1399  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.290066 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  33.01 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  28.31 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  29.29 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  28.44 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  31 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 
237 aa  72  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  29.63 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  24.09 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  27.88 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  27.67 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.33 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.33 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.33 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.33 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.33 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  25.21 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 
315 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2428  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00137  metallo-beta-lactamase family protein  26.58 
 
 
260 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.229532  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  26.88 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  24.64 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  26.83 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  30.62 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  26.09 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1287  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0372729  normal  0.0146108 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  26.32 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  25.37 
 
 
262 aa  65.1  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0415  beta-lactamase domain protein  28.87 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  33.15 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.68 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  24.32 
 
 
245 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  28.5 
 
 
260 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 
295 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
287 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  29.65 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  29.83 
 
 
361 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  26.41 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  28.29 
 
 
299 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  30.33 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  27.83 
 
 
281 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>