More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4516 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
346 aa  677    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  42.15 
 
 
348 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  39.12 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  39.94 
 
 
368 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  41.23 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  39.21 
 
 
351 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  38.99 
 
 
363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  39.56 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  36 
 
 
337 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  34.85 
 
 
321 aa  142  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  35.64 
 
 
321 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  32.48 
 
 
329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 
325 aa  132  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  34.5 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  34.32 
 
 
334 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.91 
 
 
346 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 
310 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  36.42 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  34.5 
 
 
334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  32.93 
 
 
314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  33.92 
 
 
334 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 
354 aa  123  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 
324 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  30.03 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  25.99 
 
 
324 aa  113  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 
324 aa  112  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  30.12 
 
 
324 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  30.5 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  29.97 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  26.23 
 
 
328 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 
366 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 
323 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  29.87 
 
 
341 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  29.97 
 
 
332 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  27.04 
 
 
325 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  31.06 
 
 
331 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  27.25 
 
 
343 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  30.49 
 
 
342 aa  99.4  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  31.31 
 
 
357 aa  99.4  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 
862 aa  99  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 
350 aa  99  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  26.69 
 
 
322 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  30.09 
 
 
352 aa  93.6  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 
359 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
359 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  28.4 
 
 
358 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 
323 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  28.61 
 
 
359 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 
365 aa  90.5  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  27.22 
 
 
359 aa  89.7  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  30.35 
 
 
340 aa  89  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  28.27 
 
 
335 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  27.63 
 
 
359 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  28.53 
 
 
363 aa  87  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  30.26 
 
 
362 aa  86.7  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  29.94 
 
 
354 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0552  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 
302 aa  85.9  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  29.93 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  28.94 
 
 
363 aa  85.9  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000948581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  26.14 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  29 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  24.52 
 
 
324 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  29.03 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  28.62 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  29.85 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 
361 aa  82  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  28.3 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.76 
 
 
357 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  29.8 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  28.14 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  29.08 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  29.01 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  24.7 
 
 
348 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  28.27 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  29.08 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  29.08 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  27.24 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  28.78 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  27.24 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  27.76 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  25.6 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 
356 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  28.62 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  28.38 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  27.41 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  27.41 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  27.41 
 
 
383 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  27.3 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  27.41 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  27.41 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  29.5 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>