More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1138 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
221 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  40.91 
 
 
229 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  41.1 
 
 
230 aa  179  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  34.07 
 
 
214 aa  86.7  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
302 aa  78.6  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  29.02 
 
 
290 aa  78.6  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  29.83 
 
 
329 aa  75.5  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  33.78 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  37.71 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  32.16 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 
252 aa  72  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.23 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  34.25 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  27.31 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3944  beta-lactamase  28.84 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  hitchhiker  0.000201992 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  31.29 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3954  beta-lactamase  30.11 
 
 
293 aa  68.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  32.85 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  28.76 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4017  beta-lactamase  29.55 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  36.78 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4124  beta-lactamase  28.37 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4063  beta-lactamase  27.91 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.534302  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  27.75 
 
 
306 aa  67  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  36.36 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1123  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  37.27 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  29.88 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  28.38 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  28.89 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 
327 aa  65.5  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1067  hypothetical protein  27.67 
 
 
309 aa  65.5  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.21331  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  28.71 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3259  Beta-lactamase  33.06 
 
 
298 aa  64.3  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000588922  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  34.91 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  35.82 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  27.27 
 
 
327 aa  64.3  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  29.36 
 
 
289 aa  63.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  38.64 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
217 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  35.29 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  30.99 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  30.23 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1736  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 
198 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  31.21 
 
 
288 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
192 aa  62.8  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  33.07 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 
242 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 
214 aa  62.4  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  30.07 
 
 
214 aa  62.4  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 
294 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  22.73 
 
 
319 aa  62  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 
213 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  32 
 
 
212 aa  62  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  26.24 
 
 
294 aa  62  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  32.34 
 
 
330 aa  62  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  28.74 
 
 
327 aa  62  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  27.89 
 
 
212 aa  61.6  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  25.62 
 
 
308 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 
263 aa  61.6  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  33.07 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 
305 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 
304 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  25.12 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  27.65 
 
 
299 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
307 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  33.75 
 
 
326 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  26.76 
 
 
307 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  32.98 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 
314 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  33.61 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  33.8 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  32.28 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  33.06 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  31.39 
 
 
209 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 
262 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  38.14 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  26.82 
 
 
305 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  24.64 
 
 
260 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  32.79 
 
 
214 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 
329 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 
252 aa  59.3  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  27.42 
 
 
217 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  25.84 
 
 
316 aa  58.9  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  32.39 
 
 
263 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 
324 aa  58.5  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 
205 aa  58.9  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  32.24 
 
 
208 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  30.71 
 
 
214 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 
299 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  31.41 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  26.54 
 
 
333 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>