More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4572 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  100 
 
 		 294 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  57.19 
 
 		 294 aa  345  6e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  36.96 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3880  beta-lactamase-like  34.7 
 
 		 297 aa  168  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  35.52 
 
 		 299 aa  159  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3944  beta-lactamase  32.16 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  hitchhiker  0.000201992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4124  beta-lactamase  31.76 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3954  beta-lactamase  31.76 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4017  beta-lactamase  31.76 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4063  beta-lactamase  31.76 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.534302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3259  Beta-lactamase  31.4 
 
 		 298 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000588922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  32.95 
 
 		 288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  30.92 
 
 		 290 aa  126  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1743  beta-lactamase-like  25.61 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  28.4 
 
 		 289 aa  94  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  29.7 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1851  beta-lactamase domain protein  30.12 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5001  beta-lactamase domain protein  29.94 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0521507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  29.93 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0900  metallo-beta-lactamase family protein  30.08 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  30.66 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  24.51 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  29.37 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1201  metallo-beta-lactamase family protein  30.37 
 
 		 198 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  32.62 
 
 		 207 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 230 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 231 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  38.54 
 
 		 210 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0830  metallo-beta-lactamase family protein  31.85 
 
 		 198 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0389556  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  35.96 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  27.81 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  25.12 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  34.86 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  29.29 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  25.25 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0124  thioredoxin reductase (trxr) (general stress protein 35)(Gsp35)  26.57 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  27.21 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0773  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000303439 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  26.63 
 
 		 232 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  35.23 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  23.23 
 
 		 229 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1268  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  35.05 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  23.89 
 
 		 206 aa  57  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  24.82 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  33.02 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  31.58 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0890  beta-lactamase-like  32.14 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  29.36 
 
 		 209 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  27.22 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  24.44 
 
 		 206 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  34.78 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  34.78 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1347  beta-lactamase domain protein  22.22 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  34.78 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1101  beta-lactamase domain protein  26.58 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  34.78 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  29.93 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  31.67 
 
 		 209 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  34.78 
 
 		 215 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  33.64 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  34.78 
 
 		 215 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  36.56 
 
 		 212 aa  54.3  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 348 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 		 215 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  25.74 
 
 		 221 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  25.12 
 
 		 348 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15960  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.59 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  35.11 
 
 		 215 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  32.23 
 
 		 215 aa  53.5  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  30.99 
 
 		 206 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 		 287 aa  53.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  30.84 
 
 		 209 aa  53.1  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  30.09 
 
 		 209 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  30.09 
 
 		 209 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  34.78 
 
 		 215 aa  53.1  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  29.2 
 
 		 209 aa  52.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  30.09 
 
 		 209 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  24.09 
 
 		 207 aa  53.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>