More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1743 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1743  beta-lactamase-like  100 
 
 		 289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  40.51 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  36.65 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  33.22 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  31.76 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4063  beta-lactamase  31.08 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.534302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3259  Beta-lactamase  33.65 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000588922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4124  beta-lactamase  31.47 
 
 		 293 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4017  beta-lactamase  31.47 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3944  beta-lactamase  31.08 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  hitchhiker  0.000201992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3954  beta-lactamase  31.47 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 		 294 aa  115  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  31.11 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3880  beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  25.61 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1851  beta-lactamase domain protein  33.54 
 
 		 335 aa  92.4  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  29.87 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  31.1 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5001  beta-lactamase domain protein  33.15 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0521507  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.62 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 231 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  36.73 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  32.08 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  30.56 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  30.08 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.67 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  33.82 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.51 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2191  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  32.85 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  33.06 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.88 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  35.48 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  29.93 
 
 		 205 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 		 339 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3484  beta-lactamase-like protein  33.57 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 		 263 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 		 230 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  33.68 
 
 		 205 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 		 324 aa  53.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.87 
 
 		 229 aa  52.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 		 287 aa  52.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1941  beta-lactamase domain-containing protein  31.95 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  29.33 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  32.85 
 
 		 240 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  31.78 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  29.63 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  29.08 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  28.14 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  27.54 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  32.65 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  27.18 
 
 		 222 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  28.14 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0760  beta-lactamase domain protein  33.57 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118646  normal  0.0112974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  29.34 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  28.14 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  30.6 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  24.84 
 
 		 213 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  34.29 
 
 		 208 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.85 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0115  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  26.71 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  31.71 
 
 		 222 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 		 201 aa  50.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  31.11 
 
 		 245 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  32.67 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  33.09 
 
 		 240 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  29.6 
 
 		 250 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2351  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 		 297 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  0.19339 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  25.52 
 
 		 201 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  28.47 
 
 		 318 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  35.04 
 
 		 225 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  32.26 
 
 		 207 aa  49.3  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 		 361 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 		 213 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.93 
 
 		 205 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 		 214 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2055  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.23 
 
 		 263 aa  48.9  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.413941  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  28.98 
 
 		 214 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  30.25 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  31.62 
 
 		 209 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  32.12 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  31.39 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3552  beta-lactamase domain-containing protein  28.48 
 
 		 483 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  32.76 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  32.12 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  33.55 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  28.4 
 
 		 230 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  28.57 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  31.4 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  31.39 
 
 		 240 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0199  diphthine synthase  27.56 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000243979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.44 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.117082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>