More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02855 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  100 
 
 
312 aa  633  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  67.1 
 
 
310 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  52.13 
 
 
327 aa  330  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  50.63 
 
 
333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  48.52 
 
 
330 aa  298  7e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  47.27 
 
 
318 aa  287  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  47.71 
 
 
320 aa  285  7e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  46.45 
 
 
320 aa  281  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  45.85 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  46.98 
 
 
361 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  44.37 
 
 
328 aa  257  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2964  Beta-lactamase-like  48.01 
 
 
318 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3052  beta-lactamase domain protein  48.34 
 
 
318 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3160  beta-lactamase domain protein  48.01 
 
 
318 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  45.81 
 
 
318 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  50 
 
 
318 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  34.04 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  33.22 
 
 
323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  32.63 
 
 
326 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  32.63 
 
 
323 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  32.98 
 
 
323 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  32.63 
 
 
323 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  32.63 
 
 
323 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  32.63 
 
 
326 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  32.63 
 
 
326 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  36.89 
 
 
325 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  34.85 
 
 
316 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  32.21 
 
 
310 aa  147  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  36.49 
 
 
319 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  31.35 
 
 
308 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  34.57 
 
 
307 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  36.16 
 
 
322 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  37.89 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  31.28 
 
 
331 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 
307 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  31.17 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  34.18 
 
 
337 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  29.68 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  33.48 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  30.87 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  35.51 
 
 
305 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 
312 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
305 aa  123  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  36.92 
 
 
310 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  33.63 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  34.26 
 
 
306 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  33.94 
 
 
308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  34.51 
 
 
297 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  34 
 
 
306 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 
297 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  33.64 
 
 
307 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  31.47 
 
 
298 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  31 
 
 
307 aa  99  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  26.21 
 
 
259 aa  90.1  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 
296 aa  90.1  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  31.74 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  29.14 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  31.46 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.02 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  23.67 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 
210 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
231 aa  57  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 
240 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51380  quinolone signal response protein  28.65 
 
 
301 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.874337  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  25.64 
 
 
240 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  25.21 
 
 
240 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.97 
 
 
205 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  28.39 
 
 
201 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  24.26 
 
 
240 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 
242 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  22.48 
 
 
245 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  26.97 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  29.03 
 
 
213 aa  53.9  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  29.81 
 
 
312 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  22.91 
 
 
208 aa  53.9  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 
215 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  30.38 
 
 
273 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  27.04 
 
 
209 aa  53.9  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1123  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 
204 aa  53.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 
211 aa  53.9  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  26.49 
 
 
231 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  24.02 
 
 
407 aa  53.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  32.35 
 
 
290 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.12 
 
 
215 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 
307 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 
214 aa  53.5  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  23.94 
 
 
208 aa  53.5  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  24.79 
 
 
240 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  33.71 
 
 
207 aa  52.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  26.29 
 
 
317 aa  52.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  30.67 
 
 
243 aa  52.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 
215 aa  52.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>