More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2946 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 263 aa  548  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  27.86 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  28.21 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  29.95 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  24.68 
 
 		 361 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3222  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.076596  normal  0.400192 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 		 201 aa  67  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  26.83 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0560  beta-lactamase domain-containing protein  27.83 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  26.32 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  26.04 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  22.68 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  29.58 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  27.66 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  28.88 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  24.55 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  26.67 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.67 
 
 		 312 aa  62  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  27.72 
 
 		 211 aa  62  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  27.54 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  22.93 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  24.61 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  26.09 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  27.86 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  27.83 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  26.59 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  28.08 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2035  beta-lactamase domain-containing protein  25.12 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  26.15 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  26.25 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  28.43 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  25.44 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  28.8 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  28.87 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  27.5 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  23.36 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  29 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  23.75 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  28.87 
 
 		 566 aa  56.2  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  25.73 
 
 		 363 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.74 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  27.08 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  23.68 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  23.5 
 
 		 399 aa  55.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  23.5 
 
 		 399 aa  55.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  27.22 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  25.4 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  26.21 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  26.52 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4124  beta-lactamase  27.54 
 
 		 293 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  25.6 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  26.45 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3954  beta-lactamase  27.54 
 
 		 293 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3944  beta-lactamase  27.54 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  hitchhiker  0.000201992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  25 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  24.37 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  24.3 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.26 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  27.17 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  26.67 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  26.36 
 
 		 328 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1442  beta-lactamase domain protein  32.29 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  27.95 
 
 		 308 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  26.11 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  27.15 
 
 		 556 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4017  beta-lactamase  26.81 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02317  beta-lactamase  24.87 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.914825  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  25.49 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  26.18 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  36.56 
 
 		 214 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  24.74 
 
 		 566 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  29.89 
 
 		 213 aa  53.1  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3259  Beta-lactamase  27.92 
 
 		 298 aa  53.1  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000588922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  25.57 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>