More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3924 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  98.76 
 
 		 242 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  86.67 
 
 		 243 aa  434  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  78.75 
 
 		 241 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  59.4 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  44.72 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  38.21 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 		 253 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  28.05 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.54 
 
 		 347 aa  96.7  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  32.85 
 
 		 298 aa  87  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0660  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 		 279 aa  85.5  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000276126  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  28.77 
 
 		 311 aa  85.1  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.22 
 
 		 303 aa  85.1  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  28.71 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  32.02 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  30.33 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.47 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  30.77 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  28.99 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  25.54 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 		 211 aa  67  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  32.35 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  33.17 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  29.27 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  27.72 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  33.99 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  25.32 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  26.44 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  30.39 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  31.01 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  30.39 
 
 		 334 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  23.6 
 
 		 217 aa  62  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  33.13 
 
 		 323 aa  62  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  28.83 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  25.62 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  42.86 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  27.13 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  22.91 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  28.77 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  27.81 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  30.92 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1480  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  25 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  26.05 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  39.02 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  34.64 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  25.31 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  26.84 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  21.95 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  28.19 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  24.59 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  32.17 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  25.15 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  34.59 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  25.77 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  22.35 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  23.75 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.79 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  27.74 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.79 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  24.84 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.79 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  25.75 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  21.79 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.79 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  21.79 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1292  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  24.14 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  27.03 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.79 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.07 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  21.79 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  21.79 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 315 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  21.79 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.17 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  21.79 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  21.79 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  24.1 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>