More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2704 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  100 
 
 		 316 aa  640    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  49.5 
 
 		 310 aa  308  8e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  48.53 
 
 		 330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  50.16 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  47.71 
 
 		 318 aa  295  7e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  48.01 
 
 		 327 aa  285  7e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  44.66 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  45.85 
 
 		 312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  44.87 
 
 		 320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  46.93 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  43.71 
 
 		 361 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2964  Beta-lactamase-like  46.41 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3052  beta-lactamase domain protein  46.41 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3160  beta-lactamase domain protein  46.08 
 
 		 318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  39.86 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  39.23 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  34.03 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  34.03 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  34.03 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  34.03 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  33.91 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  33.22 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  33.56 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  33.68 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  33.22 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  34.74 
 
 		 325 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  34.31 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  34.19 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 		 319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  34.6 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  31.8 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  31.86 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  33.87 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  30.06 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  36.92 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  31.46 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  35.68 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  32.1 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  30.96 
 
 		 308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  31.99 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  36.8 
 
 		 306 aa  125  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  36.18 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  36.41 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  35.19 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  29.46 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  35.64 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  31.95 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  35.24 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  28.25 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  32.92 
 
 		 264 aa  89.4  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  29.51 
 
 		 267 aa  89  9e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 		 266 aa  86.3  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  29.81 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  32.29 
 
 		 259 aa  79  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 		 234 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  31.52 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  26.38 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  34.04 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51380  quinolone signal response protein  29.65 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.874337  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  24.2 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  28.79 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.32 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  31.95 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.08 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.04 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  25.2 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  32.5 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  30.81 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4398  quinolone signal response protein  29.15 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 		 213 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  27.74 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1933  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 		 396 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.837392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  26.53 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  31.97 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 214 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  27.85 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 		 200 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3930  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 		 421 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  33.53 
 
 		 205 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  26 
 
 		 396 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  31.97 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4870  beta-lactamase domain protein  26.79 
 
 		 341 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.434908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  30.99 
 
 		 423 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  25 
 
 		 261 aa  53.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>