227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2019 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
308 aa  620  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  74.27 
 
 
308 aa  471  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  70.07 
 
 
312 aa  434  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  61.56 
 
 
331 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  57.19 
 
 
337 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  58.88 
 
 
322 aa  368  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  47.85 
 
 
310 aa  268  1e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  41.57 
 
 
310 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  36.24 
 
 
309 aa  186  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  36.58 
 
 
302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  38.8 
 
 
318 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  34.32 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 
321 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  35.33 
 
 
304 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  37.09 
 
 
318 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  36.88 
 
 
308 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  33.95 
 
 
323 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  35.54 
 
 
308 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  33.58 
 
 
326 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  33.58 
 
 
323 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  35.66 
 
 
308 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  33.58 
 
 
323 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  38.37 
 
 
301 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  35.18 
 
 
306 aa  169  6e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  33.58 
 
 
323 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  33.58 
 
 
326 aa  168  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  33.21 
 
 
323 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  35.55 
 
 
330 aa  155  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  34.94 
 
 
307 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  36.5 
 
 
325 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  38.06 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  33.44 
 
 
305 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.33 
 
 
316 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  31.89 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  33.06 
 
 
316 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  37.65 
 
 
291 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.35 
 
 
312 aa  142  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  39.61 
 
 
361 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  31.21 
 
 
318 aa  139  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  39.25 
 
 
307 aa  138  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  31.69 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  33.8 
 
 
307 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  32.34 
 
 
297 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  37.97 
 
 
264 aa  128  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  30.52 
 
 
327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 
310 aa  125  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 
333 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  30.74 
 
 
320 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3052  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 
318 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3160  beta-lactamase domain protein  38.46 
 
 
318 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2964  Beta-lactamase-like  39.46 
 
 
318 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  40.11 
 
 
267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  34.4 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  34.43 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  38.5 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  35.47 
 
 
305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  37.44 
 
 
306 aa  113  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 
266 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  29.84 
 
 
307 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 
296 aa  105  9e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  37.31 
 
 
259 aa  101  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  32.39 
 
 
266 aa  93.2  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
267 aa  87  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  28.74 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  27.08 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  28.73 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  23.73 
 
 
245 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  22.9 
 
 
228 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  22.33 
 
 
226 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  29.95 
 
 
329 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4870  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 
341 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.434908  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  28.04 
 
 
234 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  22.97 
 
 
228 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  22.01 
 
 
228 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  22.97 
 
 
228 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  37.1 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  22.34 
 
 
228 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  22.34 
 
 
228 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  22.34 
 
 
228 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  25.26 
 
 
318 aa  57.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  34.51 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  34.51 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  26.16 
 
 
231 aa  57  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  22.63 
 
 
213 aa  56.2  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  36.29 
 
 
315 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  27.51 
 
 
331 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  34 
 
 
239 aa  56.2  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1287  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 
226 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0372729  normal  0.0146108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  46.58 
 
 
290 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0033  beta-lactamase domain-containing protein  25.17 
 
 
207 aa  55.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.852974  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0033  beta-lactamase domain-containing protein  25.17 
 
 
209 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000234295  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2266  Zn-dependent hydrolase  22.01 
 
 
228 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.064814  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  42.47 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  34.95 
 
 
326 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  43.24 
 
 
322 aa  53.5  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  36.59 
 
 
314 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0307  beta-lactamase domain-containing protein  24.53 
 
 
208 aa  53.5  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.85444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>