252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2040 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  100 
 
 		 331 aa  668    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  68.4 
 
 		 337 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  66.56 
 
 		 308 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  61.56 
 
 		 308 aa  402  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  64.5 
 
 		 312 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  54.69 
 
 		 322 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  40.13 
 
 		 310 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  39.11 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  42.56 
 
 		 310 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 318 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  36.18 
 
 		 308 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  34.97 
 
 		 302 aa  169  9e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  35.25 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  32.84 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  32.47 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  37.05 
 
 		 308 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  33.44 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  32.1 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  34.31 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  31.73 
 
 		 326 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  31.73 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  37.24 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  33.08 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  37.65 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  31.73 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  31.73 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  35.51 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  34.83 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  41.51 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  33.01 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  30.56 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.63 
 
 		 316 aa  142  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  32.19 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  33.66 
 
 		 361 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.07 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  33.23 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  31.36 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  31.73 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  32.1 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  32.1 
 
 		 327 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  33.77 
 
 		 306 aa  126  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  34.06 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 		 333 aa  119  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2964  Beta-lactamase-like  40.62 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  37.31 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  37.31 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3052  beta-lactamase domain protein  40.18 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3160  beta-lactamase domain protein  40.18 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  34.2 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  36.61 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  33.04 
 
 		 267 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  35.16 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 266 aa  102  9e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  36.55 
 
 		 266 aa  97.4  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  28.57 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  27.66 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4870  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.434908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  22.42 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1287  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0372729  normal  0.0146108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0773  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000303439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  30.38 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  23.85 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  32.61 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  27.44 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  23.5 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  27.81 
 
 		 406 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  24.09 
 
 		 329 aa  53.9  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  33.94 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 294 aa  53.9  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  23.81 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 		 406 aa  53.5  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  31.62 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  28.07 
 
 		 307 aa  52.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  21.86 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  21.86 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  21.86 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51380  quinolone signal response protein  24.22 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.874337  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  25.55 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0307  beta-lactamase domain-containing protein  25.47 
 
 		 208 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.85444  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  23.46 
 
 		 226 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  25.61 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  21.17 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1292  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  23.6 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  21.96 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1485  beta-lactamase-like protein  22.42 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000931355  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 228 aa  51.2  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  29.53 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>