177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2919 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  100 
 
 
327 aa  659    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  57.01 
 
 
333 aa  353  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  56.91 
 
 
310 aa  350  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  52.13 
 
 
312 aa  330  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  51.15 
 
 
318 aa  317  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  52.22 
 
 
320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  49.84 
 
 
330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  48.01 
 
 
316 aa  285  8e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  49.68 
 
 
320 aa  282  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  45.54 
 
 
328 aa  277  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  46.56 
 
 
361 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3052  beta-lactamase domain protein  50.79 
 
 
318 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2964  Beta-lactamase-like  50.79 
 
 
318 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3160  beta-lactamase domain protein  49.84 
 
 
318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  44 
 
 
318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 
318 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  35.77 
 
 
323 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  35.04 
 
 
323 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 
321 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  33.01 
 
 
326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  32.41 
 
 
326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  36.23 
 
 
323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  34.67 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  32.69 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  35.85 
 
 
323 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  33.11 
 
 
310 aa  147  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  37.25 
 
 
325 aa  143  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  36.71 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  35.09 
 
 
309 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  28.35 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  31.23 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  32.03 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  30.52 
 
 
308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  32.9 
 
 
308 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  38 
 
 
310 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  30.42 
 
 
331 aa  119  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  36.49 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  34.98 
 
 
305 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  30.67 
 
 
308 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 
322 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  31 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  30.92 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  33.02 
 
 
306 aa  109  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 
307 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
301 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  29.54 
 
 
298 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  33.8 
 
 
306 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  29.77 
 
 
308 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  28.62 
 
 
305 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  32.07 
 
 
307 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
304 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  33.96 
 
 
306 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  27.24 
 
 
337 aa  92.8  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  32.93 
 
 
259 aa  77  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  38.85 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  25.4 
 
 
267 aa  60.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  29.47 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  32.08 
 
 
205 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  26.2 
 
 
221 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1077  beta-lactamase domain protein  33.13 
 
 
226 aa  54.7  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  36.05 
 
 
326 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  32.39 
 
 
339 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  27.27 
 
 
229 aa  53.1  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  30.81 
 
 
363 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  25.48 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  30.36 
 
 
308 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  29.48 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
242 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 
207 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  30.84 
 
 
340 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 
324 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  28.25 
 
 
332 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  25.61 
 
 
348 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  30.83 
 
 
251 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  22.78 
 
 
230 aa  49.3  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  30.07 
 
 
209 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  22.33 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  26.87 
 
 
200 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 
210 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  23.6 
 
 
209 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  31.05 
 
 
208 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0561  beta-lactamase-like  23.87 
 
 
260 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.15 
 
 
329 aa  47.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 
241 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  24.68 
 
 
213 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  31.74 
 
 
207 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  30.46 
 
 
214 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 
215 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  27.35 
 
 
213 aa  47.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
393 aa  47  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  30.18 
 
 
327 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 
303 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>