More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1760 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  100 
 
 		 229 aa  466  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  40.91 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  31.16 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  29.18 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  31.33 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  30.29 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4017  beta-lactamase  29.48 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3944  beta-lactamase  28.9 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  hitchhiker  0.000201992 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  30.19 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3954  beta-lactamase  28.9 
 
 		 293 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4063  beta-lactamase  29.48 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.534302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4124  beta-lactamase  28.9 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.58 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  28.23 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  28.67 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  28.67 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5001  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0521507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3259  Beta-lactamase  28.32 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000588922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.36 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  30 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  29.47 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  31.01 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  31.46 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  30.1 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  32.68 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  29.34 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  31.32 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  26.48 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  26.11 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  29.44 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  30 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  23.23 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  24.41 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  25.71 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  28.07 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  27.03 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  26.11 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  27.03 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 		 276 aa  57  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  35.16 
 
 		 361 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  28.31 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  27.46 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  31.91 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  27.11 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  35 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  30.77 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  27.71 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  28.57 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  30.77 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  30.77 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  30.77 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  30.77 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  28.34 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  25.46 
 
 		 307 aa  55.1  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  27.21 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  22.82 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1123  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  26.54 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  29.1 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  28.42 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  29.24 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  26.72 
 
 		 334 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  26.84 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  31.36 
 
 		 375 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  28.97 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>