179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3259 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3259  Beta-lactamase  100 
 
 		 298 aa  605  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000588922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4017  beta-lactamase  63.54 
 
 		 293 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3954  beta-lactamase  59.66 
 
 		 293 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4124  beta-lactamase  62.82 
 
 		 293 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4063  beta-lactamase  62.82 
 
 		 293 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.534302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3944  beta-lactamase  62.82 
 
 		 293 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  hitchhiker  0.000201992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  39.11 
 
 		 299 aa  209  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  35.5 
 
 		 290 aa  179  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  35.56 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  36.4 
 
 		 288 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3880  beta-lactamase-like  32.43 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  28.72 
 
 		 294 aa  146  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  31.4 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  34.19 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1743  beta-lactamase-like  33.65 
 
 		 289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  34.76 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1851  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  28.07 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5001  beta-lactamase domain protein  34.38 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0521507  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  28.32 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  30.06 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.44 
 
 		 207 aa  57  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  29.01 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  32.5 
 
 		 214 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  29.14 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 		 251 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  32.98 
 
 		 205 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 		 263 aa  52.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0092  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.43 
 
 		 215 aa  52.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.76232 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2282  metallo-beta-lactamase family protein  26.44 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0400528  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  24.14 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 210 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  32.03 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  30.71 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0110  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.41 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 		 221 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2304  metallo-beta-lactamase family protein  26.32 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2116  metallo-beta-lactamase family protein  26.32 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2172  metallo-beta-lactamase family protein  26.32 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  32.94 
 
 		 218 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  27.98 
 
 		 262 aa  50.4  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  30.4 
 
 		 220 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 214 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  25.56 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  25.93 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0675  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.5 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  31.41 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  26.45 
 
 		 231 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  26.77 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  27.81 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  23.53 
 
 		 209 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6334  beta-lactamase-like  27.81 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1745  beta-lactamase domain-containing protein  27.81 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.462526  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  29.51 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1933  beta-lactamase domain-containing protein  24.79 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.837392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  33.7 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  30.77 
 
 		 240 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  27.66 
 
 		 207 aa  47  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  24.34 
 
 		 363 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1761  beta-lactamase domain-containing protein  27.81 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 215 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 		 231 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.53 
 
 		 222 aa  46.6  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  22.63 
 
 		 213 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  28.97 
 
 		 205 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 		 217 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.44 
 
 		 292 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  27.45 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 		 337 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 229 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  30.77 
 
 		 229 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.73 
 
 		 258 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 		 210 aa  45.8  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  32.05 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  30.13 
 
 		 240 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.68 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  28.15 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  23.16 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1666  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.82 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26350  hypothetical protein  27.41 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.901588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  29.08 
 
 		 207 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  25.77 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  26.77 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  26.37 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  26.84 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  24.22 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>