More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2131 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 337 aa  667    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  48.62 
 
 		 339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  48.01 
 
 		 332 aa  279  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  42.99 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  43.3 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  41.72 
 
 		 327 aa  229  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  40.68 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  36.7 
 
 		 351 aa  190  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  36 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  32 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.74 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  33.23 
 
 		 331 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  34.56 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  34.06 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  34.17 
 
 		 324 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  29.97 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  30.16 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  33.44 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 		 322 aa  139  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  32.06 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 		 350 aa  132  9e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  28.62 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 		 862 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  33.79 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  29.07 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  31.46 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 330 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  30.22 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  28.97 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 		 334 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  31.76 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  28.57 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  28.23 
 
 		 328 aa  99.8  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  32.34 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  30.09 
 
 		 342 aa  96.7  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.37 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  28.03 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 		 358 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  27.22 
 
 		 353 aa  93.2  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  26.83 
 
 		 348 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 		 400 aa  93.2  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  28.25 
 
 		 321 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  30.7 
 
 		 344 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  29.14 
 
 		 357 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  30.09 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  29.2 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  30.09 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  30.09 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  30.09 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  30.09 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  30.09 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  28.91 
 
 		 359 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  28.91 
 
 		 359 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  27.48 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  28.91 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  28.91 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.25 
 
 		 352 aa  87.4  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  29.08 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  27.7 
 
 		 361 aa  87.4  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  29.78 
 
 		 331 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 354 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  27.38 
 
 		 352 aa  86.3  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 		 357 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  26.38 
 
 		 341 aa  85.9  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  27.97 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3168  beta-lactamase domain-containing protein  23.77 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00770543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  27.36 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  28.75 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  30.61 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0337  beta-lactamase domain-containing protein  27.88 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  30.18 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  29.75 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  29.27 
 
 		 359 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  28.98 
 
 		 326 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  26.51 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.68 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  27.13 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  30 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.94 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  29.28 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  27.78 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  32.76 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  28.96 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  25.82 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>