More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1111 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  100 
 
 		 299 aa  611  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4124  beta-lactamase  40.21 
 
 		 293 aa  235  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3944  beta-lactamase  40.55 
 
 		 293 aa  234  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  hitchhiker  0.000201992 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4017  beta-lactamase  40.21 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4063  beta-lactamase  40.21 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.534302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3954  beta-lactamase  40.21 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3259  Beta-lactamase  39.11 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000588922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  41.13 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  44.29 
 
 		 290 aa  201  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3880  beta-lactamase-like  42.91 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  40.53 
 
 		 288 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  36.12 
 
 		 294 aa  169  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  35.52 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  36.69 
 
 		 289 aa  134  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1743  beta-lactamase-like  33.72 
 
 		 289 aa  125  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1851  beta-lactamase domain protein  31.01 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  31.38 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5001  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 		 350 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0521507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  35.15 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  26.11 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  32.3 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  27.2 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.6 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  36.29 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.9 
 
 		 222 aa  62  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  37.1 
 
 		 209 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  30.27 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  28.78 
 
 		 232 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  27.65 
 
 		 221 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  32.59 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  26.52 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  35.77 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  31.11 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  26.19 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  31.43 
 
 		 243 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  31.09 
 
 		 329 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  27.38 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1480  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  24.03 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  24.4 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  26.07 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  34.4 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  32.09 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  31.62 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 214 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  33.63 
 
 		 205 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 297 aa  53.9  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  23.39 
 
 		 205 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  29.21 
 
 		 214 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 		 231 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 209 aa  53.5  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 214 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  30.99 
 
 		 230 aa  53.1  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 		 214 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  24.66 
 
 		 231 aa  52.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  29.05 
 
 		 298 aa  52.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  26.14 
 
 		 310 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  31.06 
 
 		 217 aa  52.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  27.78 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  33.85 
 
 		 213 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  30.89 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 		 214 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0189  beta-lactamase domain protein  28.05 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0949423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  26.53 
 
 		 213 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  30.49 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  28.65 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  36.13 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2026  beta-lactamase domain protein  27.33 
 
 		 209 aa  50.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000455404 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  24.36 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  28.42 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  28.42 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  32.67 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  28.42 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  28.42 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.42 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  31.45 
 
 		 218 aa  50.4  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  28.42 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  28.42 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  28.42 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>