277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1904 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
289 aa  588  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1743  beta-lactamase-like  40.4 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  37.83 
 
 
290 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  36.9 
 
 
288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  32.58 
 
 
290 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  35.48 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3259  Beta-lactamase  32.82 
 
 
298 aa  122  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000588922  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3944  beta-lactamase  30.36 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  hitchhiker  0.000201992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4124  beta-lactamase  30 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3954  beta-lactamase  30 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4017  beta-lactamase  30 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4063  beta-lactamase  30 
 
 
293 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.534302  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 
294 aa  108  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  28.4 
 
 
294 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3880  beta-lactamase-like  31.42 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  27.83 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1851  beta-lactamase domain protein  26.37 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5001  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0521507  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  29.77 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  30 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  29.58 
 
 
307 aa  60.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  34 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.87 
 
 
222 aa  57.4  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  34.56 
 
 
243 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  33.11 
 
 
240 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  32.45 
 
 
240 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  26.7 
 
 
232 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  32.3 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 
221 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  36.57 
 
 
240 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  32.67 
 
 
240 aa  56.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  27.06 
 
 
231 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.87 
 
 
207 aa  55.8  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  32.45 
 
 
240 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  31.79 
 
 
240 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  30.47 
 
 
213 aa  53.9  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0249  beta-lactamase domain protein  35.9 
 
 
248 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  33.86 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  34.19 
 
 
208 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  30 
 
 
201 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  29.77 
 
 
298 aa  53.1  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
251 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  32.21 
 
 
240 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  33.62 
 
 
210 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 
205 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  32.21 
 
 
240 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4149  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 
303 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 
210 aa  52.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  31.01 
 
 
213 aa  52.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  28.47 
 
 
324 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  26.73 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0115  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.298027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  29.78 
 
 
240 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 
241 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 
213 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1268  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 
288 aa  50.4  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3334  Beta-lactamase-like  29.88 
 
 
245 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973711  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  24.56 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 
201 aa  50.8  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  27.74 
 
 
266 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0544  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 
208 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.591388  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 
324 aa  50.4  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  32.14 
 
 
287 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  25.29 
 
 
311 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 
305 aa  50.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 
391 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
235 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  31.33 
 
 
294 aa  49.7  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
210 aa  49.7  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  24.05 
 
 
250 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  28.89 
 
 
318 aa  49.3  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  32.48 
 
 
209 aa  49.3  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1995  hypothetical protein  30.63 
 
 
431 aa  49.3  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.220897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  30.77 
 
 
321 aa  49.3  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 
208 aa  49.3  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0128  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 
303 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.736109  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0462  metallo-beta-lactamase family protein  23.38 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000870775  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.77 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  28.78 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  29.87 
 
 
231 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 
209 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 
230 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  30.87 
 
 
285 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 
361 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1152  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 
395 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000210846  decreased coverage  0.000000422487 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  30.83 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.74 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.25 
 
 
239 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  24.05 
 
 
250 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.35 
 
 
248 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  30.54 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  25 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  23.63 
 
 
395 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  30.54 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  30.27 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 
221 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>