More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0220 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
276 aa  566  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5001  beta-lactamase domain protein  37.63 
 
 
350 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0521507  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1851  beta-lactamase domain protein  32.31 
 
 
335 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  32.77 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  29.76 
 
 
290 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  31.85 
 
 
288 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3259  Beta-lactamase  34.76 
 
 
298 aa  92.8  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000588922  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  26.77 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  26.85 
 
 
290 aa  86.3  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  28.72 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1743  beta-lactamase-like  29.87 
 
 
289 aa  79  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  26.39 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3880  beta-lactamase-like  25.89 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3954  beta-lactamase  29.26 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  29.27 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4017  beta-lactamase  29.26 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3944  beta-lactamase  29.26 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  hitchhiker  0.000201992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4124  beta-lactamase  29.26 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4063  beta-lactamase  29.26 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.534302  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0269  metallo-beta-lactamase family protein  32.39 
 
 
229 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0446  beta-lactamase domain protein  32.39 
 
 
229 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 
198 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.97 
 
 
207 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 
214 aa  65.1  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  28.49 
 
 
363 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0922  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.470849  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  35.48 
 
 
205 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 
206 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  32.08 
 
 
205 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  28.65 
 
 
205 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  27.55 
 
 
230 aa  60.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 
212 aa  60.1  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  28.65 
 
 
217 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  35.4 
 
 
201 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  33.61 
 
 
210 aa  59.7  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 
287 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  33.57 
 
 
229 aa  59.7  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 
231 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2019  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.22 
 
 
282 aa  59.3  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.612705  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0570  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501842 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  37.61 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  37.61 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  32.97 
 
 
214 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 
201 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  29.84 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0110  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.21 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 
205 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  32.04 
 
 
215 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  31.87 
 
 
214 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  37.25 
 
 
210 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 
218 aa  56.6  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  32.43 
 
 
229 aa  56.6  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  34.07 
 
 
214 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 
208 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
214 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 
214 aa  55.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  25.48 
 
 
325 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  32.97 
 
 
214 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 
324 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  29.23 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.7 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0462  metallo-beta-lactamase family protein  28.86 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000870775  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 
213 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.7 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.7 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.43 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  38.04 
 
 
208 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  31.06 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0457  Beta-lactamase-like  27.19 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.7 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  24.38 
 
 
346 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.52 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  24.83 
 
 
339 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.7 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2827  beta-lactamase domain-containing protein  35.63 
 
 
214 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0208272 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 
205 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 
327 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0078  Beta-lactamase-like  26.32 
 
 
294 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1790  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.85 
 
 
290 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  31.58 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 
214 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 
209 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  27.64 
 
 
329 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 
214 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  28.47 
 
 
207 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 
209 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  29.91 
 
 
354 aa  53.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 
356 aa  53.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  27.5 
 
 
217 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  31.58 
 
 
215 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 
357 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  30.51 
 
 
218 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  31.36 
 
 
218 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  25.9 
 
 
297 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.07 
 
 
212 aa  52.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  22.67 
 
 
337 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>