More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2146 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  100 
 
 
290 aa  590  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  44.29 
 
 
299 aa  192  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3944  beta-lactamase  35.47 
 
 
293 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  hitchhiker  0.000201992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3954  beta-lactamase  35.14 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4017  beta-lactamase  35.14 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4124  beta-lactamase  34.8 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4063  beta-lactamase  34.8 
 
 
293 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.534302  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3259  Beta-lactamase  39.55 
 
 
298 aa  172  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000588922  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  33.33 
 
 
290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  38.58 
 
 
289 aa  156  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  33.08 
 
 
288 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1743  beta-lactamase-like  36.65 
 
 
289 aa  143  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3880  beta-lactamase-like  34.4 
 
 
297 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  30.92 
 
 
294 aa  126  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  26.21 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1851  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  29.44 
 
 
232 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 
214 aa  68.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5001  beta-lactamase domain protein  25.33 
 
 
350 aa  65.9  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0521507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  37.97 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  29.87 
 
 
218 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  37.21 
 
 
240 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  32.94 
 
 
273 aa  62.4  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  30.95 
 
 
206 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  26.16 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  31.01 
 
 
201 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 
221 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 
234 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.44 
 
 
222 aa  60.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  38.39 
 
 
214 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  38.39 
 
 
214 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  27.78 
 
 
295 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  32.59 
 
 
230 aa  58.9  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  34.09 
 
 
205 aa  58.9  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.13 
 
 
207 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  26.05 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  24.41 
 
 
229 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  40.22 
 
 
214 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  28.19 
 
 
206 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.17 
 
 
329 aa  57  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 
214 aa  57  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
231 aa  57  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0800  beta-lactamase domain-containing protein  31.9 
 
 
306 aa  56.6  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.44102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09640  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 
298 aa  56.6  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  35.16 
 
 
226 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  33.98 
 
 
205 aa  56.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  39.77 
 
 
211 aa  56.2  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  26.62 
 
 
339 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  30.46 
 
 
214 aa  56.2  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  30.66 
 
 
304 aa  55.8  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0249  beta-lactamase domain protein  48.15 
 
 
248 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 
251 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6720  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.11 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.790401  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  26.04 
 
 
210 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  29.38 
 
 
219 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1422  beta-lactamase-like protein  26.63 
 
 
221 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.96 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 
213 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  31.65 
 
 
213 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 
215 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3498  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 
216 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0919016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1588  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 
237 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 
231 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3589  Beta-lactamase-like  29.46 
 
 
298 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  25.2 
 
 
363 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 
214 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0830  metallo-beta-lactamase family protein  30.23 
 
 
198 aa  52.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0389556  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 
204 aa  52.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  37.14 
 
 
226 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  30.84 
 
 
213 aa  52.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 
213 aa  52.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  29.93 
 
 
263 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  22.33 
 
 
213 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 
243 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  34.53 
 
 
213 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 
287 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.86 
 
 
212 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1101  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 
232 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 
205 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 
321 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 
215 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3771  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 
216 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.85 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.85 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  28.17 
 
 
209 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.85 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.85 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0122  beta-lactamase-like  30.33 
 
 
212 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.151592  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2168  beta-lactamase-like protein  30 
 
 
284 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.583508  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.65 
 
 
255 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.85 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1201  metallo-beta-lactamase family protein  29.07 
 
 
198 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 
216 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  31.41 
 
 
209 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  33.71 
 
 
252 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  26.13 
 
 
262 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>