More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0215 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 252 aa  501  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  44.59 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0531  beta-lactamase-like protein  46.35 
 
 		 242 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235067  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0521  beta-lactamase domain-containing protein  46.35 
 
 		 242 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0543  beta-lactamase domain-containing protein  46.35 
 
 		 242 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  41.63 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0249  beta-lactamase domain protein  42.44 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  44.35 
 
 		 242 aa  181  9.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4384  beta-lactamase domain protein  40.6 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0493064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  41.88 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  35.74 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.93 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 		 237 aa  96.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  31.7 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  30.14 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  25.56 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  30.64 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  26.22 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  30.7 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  30.12 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  25.89 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  25.33 
 
 		 217 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  25.11 
 
 		 217 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  30.49 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  31.9 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  25.79 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  26.36 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  33.88 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  38.22 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  25.78 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  25.78 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  25.33 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  25.78 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  25.78 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  30.32 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  28.94 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2754  beta-lactamase-like protein  25.82 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  26.02 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 		 210 aa  62  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 		 324 aa  62  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0022  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.887133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  26.47 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  30.09 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  29 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  27.59 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  27.11 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  30.81 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.54 
 
 		 346 aa  58.9  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  25.31 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  29.9 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22660  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.75 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.662338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  32.27 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  27.06 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  35.96 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  32.57 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  28.88 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  23.36 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  26.61 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51250  hypothetical protein  42.53 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188489 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 		 200 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  27.15 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  27.15 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  26.84 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15960  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.12 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  25.21 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  25.45 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  29.49 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.29 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 		 308 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1748  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  29.47 
 
 		 327 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7234  Beta-lactamase-like  31.84 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  35.15 
 
 		 304 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  31.4 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  27.75 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  31.79 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 303 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>