More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0619 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
240 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  34.08 
 
 
239 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  33.19 
 
 
242 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  34.08 
 
 
226 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  35.02 
 
 
231 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  29.3 
 
 
217 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  28.84 
 
 
217 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  29.22 
 
 
241 aa  95.5  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  37.8 
 
 
214 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  35.96 
 
 
228 aa  92.4  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 
231 aa  91.7  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  28.37 
 
 
217 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  30.35 
 
 
217 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  30.35 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  31.96 
 
 
217 aa  85.9  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  38.22 
 
 
273 aa  85.9  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  34.59 
 
 
290 aa  85.5  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  30.35 
 
 
217 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  30.35 
 
 
217 aa  85.1  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  30.35 
 
 
217 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  30.35 
 
 
217 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  31.36 
 
 
321 aa  81.6  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  30.85 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  31.05 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  34.32 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
285 aa  79  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
281 aa  79  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  31.63 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  30.73 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  32.69 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  32.9 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  38.52 
 
 
296 aa  75.5  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  34.19 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  34.19 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  32.05 
 
 
285 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1399  beta-lactamase domain protein  29.2 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.290066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  36.63 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  28.04 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  33.16 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  30.64 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.95 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  32.22 
 
 
237 aa  72  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  31.61 
 
 
281 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  31.11 
 
 
332 aa  72  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  33.53 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 
216 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  29.92 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  32.26 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  37.24 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  27.87 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  29.8 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0337  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4154  beta-lactamase domain-containing protein  36.11 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  27.63 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  37.11 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1101  beta-lactamase domain protein  32.1 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  30.3 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  26.25 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  29.58 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  30.85 
 
 
328 aa  68.9  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  26.6 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  30.12 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  31.28 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  26.88 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  32.9 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 
282 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  27.45 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  35.86 
 
 
299 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  28.73 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 
244 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  30.61 
 
 
327 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0062  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 
336 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  26.07 
 
 
228 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  26.04 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2142  metallo-beta-lactamase family protein  30.3 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.84321  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0508  beta-lactamase domain protein  33.56 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  28.46 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  28.46 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  35 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  31.93 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  32.12 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>