More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3547 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  530  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  33.49 
 
 
232 aa  115  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  30.09 
 
 
263 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2754  beta-lactamase-like protein  27.39 
 
 
238 aa  95.9  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 
252 aa  89  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1287  beta-lactamase domain-containing protein  33.18 
 
 
226 aa  87  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0372729  normal  0.0146108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  33.62 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  26.45 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4498  beta-lactamase domain-containing protein  26.24 
 
 
194 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  30.37 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4497  beta-lactamase domain-containing protein  27.48 
 
 
208 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000128242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  30.14 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  30.37 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05310  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.24 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  32.66 
 
 
207 aa  72  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  32.23 
 
 
231 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  32.92 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1310  beta-lactamase domain protein  27.36 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4168  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  26.98 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  28.27 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  31.55 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  27.23 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  31.19 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 
192 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  31.55 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 
200 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  31.48 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 
206 aa  67  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0657  beta-lactamase domain-containing protein  32.54 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000018109  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0415  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  29.86 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  27.75 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  34.18 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  29.63 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  30.27 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  27.48 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0460  beta-lactamase domain protein  25.46 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516875  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 
208 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 
205 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  27.32 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  27 
 
 
232 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 
205 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  37.97 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 
214 aa  64.3  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 
246 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 
211 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  31.47 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  25.11 
 
 
242 aa  63.9  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1123  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 
204 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  28.1 
 
 
221 aa  63.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  25.91 
 
 
217 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  25.3 
 
 
329 aa  62.4  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  25.91 
 
 
217 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1024  beta-lactamase domain protein  32.35 
 
 
256 aa  62.4  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  25.91 
 
 
217 aa  62.4  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  25.91 
 
 
217 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  25.91 
 
 
217 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  31.4 
 
 
211 aa  62  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  26.19 
 
 
345 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  27.98 
 
 
300 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  25.17 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  26.76 
 
 
208 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  27.72 
 
 
208 aa  61.6  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  25.57 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  31.46 
 
 
205 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  26.96 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 
324 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  26.96 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 
214 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  25.82 
 
 
324 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  24.8 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  29.44 
 
 
218 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  28 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2327  beta-lactamase domain protein  25.65 
 
 
319 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 
322 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  26.48 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  26.05 
 
 
230 aa  60.1  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  24.88 
 
 
297 aa  59.7  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  26.79 
 
 
329 aa  59.3  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  27.7 
 
 
302 aa  59.7  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  25.35 
 
 
246 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  25.25 
 
 
294 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>