More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1085 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1085  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 263 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  38.86 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2203  beta-lactamase domain-containing protein  37.12 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  37.32 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  30.09 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1287  beta-lactamase domain-containing protein  37.44 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0372729  normal  0.0146108 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  32.88 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  36.63 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  31.51 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  33.94 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  32.74 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  28.22 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  32.43 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00137  metallo-beta-lactamase family protein  27.97 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.229532  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  32.53 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  33.18 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  34.76 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  32.75 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  32.3 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2710  beta-lactamase domain protein  31.51 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  36.09 
 
 		 329 aa  65.5  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0521  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4497  beta-lactamase domain-containing protein  26.58 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000128242  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  33.71 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0531  beta-lactamase-like protein  32.74 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235067  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  29.46 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0543  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  34.15 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  33.14 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4417  beta-lactamase domain-containing protein  35.37 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  31.38 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0286  metallo-beta-lactamase family protein  31.16 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0623831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  32.09 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2754  beta-lactamase-like protein  25.14 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  35.37 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  28.24 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  28.24 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  33.33 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  32.68 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0797  beta-lactamase domain-containing protein  34.69 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0697  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0317435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4498  beta-lactamase domain-containing protein  30.23 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  31.29 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  29.25 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  28.44 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  32.95 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0212  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  33.77 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  30.06 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  30.92 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 		 339 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4063  beta-lactamase  28.26 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.534302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.18 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4124  beta-lactamase  27.72 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  29.58 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0657  beta-lactamase domain-containing protein  31.14 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000018109  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4017  beta-lactamase  27.17 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0035  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  29.73 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3954  beta-lactamase  27.17 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1123  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  29.72 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  24.65 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  29.59 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0460  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516875  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  34.78 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3944  beta-lactamase  28.02 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  hitchhiker  0.000201992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  33.72 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06736  zinc metallohydrolase  34.93 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  28.44 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  32.89 
 
 		 208 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  29.78 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  32.89 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  30.13 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 		 332 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  30.06 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 327 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 		 217 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  29.07 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  29.59 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  31.6 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000827  zn-dependent hydrolase  28.7 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000173508  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  32.69 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>