261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1851 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1851  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
335 aa  696    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  55.05 
 
 
308 aa  345  6e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5001  beta-lactamase domain protein  36.78 
 
 
350 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0521507  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0220  beta-lactamase domain protein  32.31 
 
 
276 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.90359e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  29.93 
 
 
299 aa  112  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  34.25 
 
 
290 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  30.86 
 
 
288 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1743  beta-lactamase-like  32.92 
 
 
289 aa  87.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1904  beta-lactamase-like protein  27.8 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4124  beta-lactamase  26.79 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4017  beta-lactamase  26.36 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3944  beta-lactamase  26.79 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  hitchhiker  0.000201992 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4063  beta-lactamase  25.97 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.534302  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3954  beta-lactamase  26.79 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3259  Beta-lactamase  30.81 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000588922  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0562  beta-lactamase domain protein  25.9 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.155939  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2146  Beta-lactamase  30.04 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4572  Beta-lactamase  30.12 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  31.14 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3880  beta-lactamase-like  26.74 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24697  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  27.42 
 
 
298 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  31.91 
 
 
210 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  26.03 
 
 
297 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  32.97 
 
 
205 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  27.7 
 
 
229 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  27.1 
 
 
230 aa  56.2  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  28.3 
 
 
297 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0773  beta-lactamase domain protein  23.35 
 
 
320 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000303439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  32.73 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 
206 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  27.72 
 
 
232 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 
318 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 
213 aa  53.5  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3386  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 
428 aa  52.8  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  23.88 
 
 
399 aa  52.8  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  23.88 
 
 
399 aa  52.8  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 
263 aa  52.8  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  36.61 
 
 
214 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  30.32 
 
 
328 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0297  Hydroxyacylglutathione hydrolase  27.65 
 
 
239 aa  52  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000396762  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  25.84 
 
 
361 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 
234 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  27.47 
 
 
201 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 
214 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  24.26 
 
 
229 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  32.09 
 
 
285 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  31.06 
 
 
397 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  29.53 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 
214 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
214 aa  50.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  23.86 
 
 
209 aa  50.4  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1268  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 
288 aa  50.4  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  27.05 
 
 
206 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  27.74 
 
 
321 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1493  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
214 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.51 
 
 
396 aa  50.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 
214 aa  49.7  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  29.45 
 
 
217 aa  49.7  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 
284 aa  49.3  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0560  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 
267 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  29.14 
 
 
314 aa  49.7  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 
318 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 
214 aa  49.3  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  29.38 
 
 
327 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  25.15 
 
 
201 aa  49.3  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  27.97 
 
 
205 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  27.89 
 
 
208 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  28.39 
 
 
327 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0932  Beta-lactamase-like  26.67 
 
 
229 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  31.58 
 
 
287 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  32.41 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  40.68 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.48 
 
 
255 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2688  beta-lactamase-like protein  33.87 
 
 
250 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  28.45 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 
266 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  26.23 
 
 
264 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1080  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 
284 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000140431  normal  0.247329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  27.48 
 
 
262 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  27.21 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  27.21 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0257  beta-lactamase domain protein  36.17 
 
 
397 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3682  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 
255 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  40.74 
 
 
304 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  22.54 
 
 
207 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  38.2 
 
 
214 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  36.56 
 
 
214 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
470 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
201 aa  47.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  30.91 
 
 
219 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  36.56 
 
 
214 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  29.29 
 
 
210 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 
324 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
210 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 
332 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  38.2 
 
 
214 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  38.2 
 
 
214 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0876  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.41 
 
 
394 aa  47.4  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000351493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>