More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2708 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 325 aa  650    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  33.55 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  34.56 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  29.85 
 
 		 348 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  30.09 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  32.27 
 
 		 363 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 		 351 aa  139  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  30.03 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  30.7 
 
 		 346 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  25.25 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  27.21 
 
 		 310 aa  119  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  29.43 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  30.79 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  28.91 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  25.16 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  27.48 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  27.76 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  28.82 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  27.09 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  27.3 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  26.71 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  23.89 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  26.8 
 
 		 322 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.58 
 
 		 346 aa  96.7  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 		 862 aa  95.9  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  30.03 
 
 		 335 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  26.86 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  27.21 
 
 		 321 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  28.85 
 
 		 331 aa  86.3  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 323 aa  86.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  29.88 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  29.9 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  26.4 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  27.08 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  30.93 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  23.71 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  28.28 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3735  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.555348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  25.17 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1851  beta-lactamase domain protein  30.32 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  25.84 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  24.91 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  29.72 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  26.54 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  27.99 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19030  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.19 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  24.07 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  28.51 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  26.71 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  27.35 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 230 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  24.91 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  22.99 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  27.9 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  29.46 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  23.17 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  24.37 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  37.04 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1268  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  27.86 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  26.4 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  29.88 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1748  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4063  beta-lactamase  27.5 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.534302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  26.64 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  27.1 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  21.77 
 
 		 354 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  25.34 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4124  beta-lactamase  27.5 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  28.38 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  25.7 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4017  beta-lactamase  29.9 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  25.27 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4497  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000128242  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3954  beta-lactamase  29.9 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4168  beta-lactamase domain protein  31.08 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3944  beta-lactamase  27.08 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.896409  hitchhiker  0.000201992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>