273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2482 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
318 aa  652    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  69.4 
 
 
318 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  46.54 
 
 
323 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  46.23 
 
 
323 aa  323  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  46.69 
 
 
321 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  46.2 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  46.2 
 
 
326 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  46.2 
 
 
323 aa  319  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  45.91 
 
 
323 aa  318  9e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  45.89 
 
 
326 aa  315  6e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  45.89 
 
 
323 aa  315  6e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  41.69 
 
 
361 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  39.55 
 
 
316 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  50 
 
 
312 aa  208  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  39.62 
 
 
328 aa  206  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  44 
 
 
327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  40.57 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  41.79 
 
 
320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  36.49 
 
 
318 aa  192  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  36.45 
 
 
330 aa  186  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  41.8 
 
 
310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  39.44 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  42.63 
 
 
333 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  41.89 
 
 
316 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3160  beta-lactamase domain protein  39.69 
 
 
318 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  37.09 
 
 
308 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3052  beta-lactamase domain protein  40 
 
 
318 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  41.78 
 
 
310 aa  167  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2964  Beta-lactamase-like  39.62 
 
 
318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  35.25 
 
 
331 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  37.55 
 
 
308 aa  165  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  37.71 
 
 
308 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  35.92 
 
 
322 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  38.49 
 
 
310 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  32.61 
 
 
312 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  32.79 
 
 
308 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  35.81 
 
 
305 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  35.14 
 
 
319 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  37.6 
 
 
309 aa  150  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  32.37 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  35.92 
 
 
337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  36.55 
 
 
302 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  35.39 
 
 
308 aa  139  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  35.28 
 
 
297 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  32.59 
 
 
305 aa  136  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  38.24 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  38.5 
 
 
301 aa  133  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  37.17 
 
 
307 aa  126  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 
291 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 
307 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  36.12 
 
 
298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  30.24 
 
 
297 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  32.51 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  33.95 
 
 
306 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  32.43 
 
 
307 aa  96.7  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 
296 aa  92.4  8e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 
267 aa  87  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  26.62 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  25.4 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  30.58 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 
259 aa  67  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  28.24 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  31.76 
 
 
407 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  24.13 
 
 
287 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  31.43 
 
 
407 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0006  beta-lactamase domain protein  31.21 
 
 
425 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51380  quinolone signal response protein  30.66 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.874337  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  31.97 
 
 
396 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
407 aa  59.7  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  25.86 
 
 
267 aa  59.7  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  24.02 
 
 
213 aa  59.3  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4398  quinolone signal response protein  29.63 
 
 
301 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.635712  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  24.78 
 
 
211 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  29.14 
 
 
399 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  29.14 
 
 
399 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  30.64 
 
 
407 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
400 aa  57.4  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  28.51 
 
 
566 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 
226 aa  56.2  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  34.56 
 
 
315 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  27.48 
 
 
317 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  37.65 
 
 
216 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0462  metallo-beta-lactamase family protein  22.44 
 
 
269 aa  53.9  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000870775  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0773  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 
320 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000303439 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  24.79 
 
 
241 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1413  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 
392 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  27.32 
 
 
292 aa  53.1  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0026  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 
407 aa  53.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  27.06 
 
 
288 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  25.75 
 
 
263 aa  52.8  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1920  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 
393 aa  52.8  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0005  beta-lactamase domain protein  28.82 
 
 
407 aa  52.4  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5001  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 
350 aa  52.8  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0521507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  25.87 
 
 
395 aa  52.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 
297 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 
310 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05310  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.14 
 
 
238 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2966  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.57 
 
 
575 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>