184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1649 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 333 aa  674    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  57.01 
 
 		 327 aa  358  7e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  55.63 
 
 		 310 aa  328  5.0000000000000004e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  50.63 
 
 		 312 aa  309  5e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  46.42 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  47.02 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  45.66 
 
 		 318 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  44.55 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  46.93 
 
 		 316 aa  270  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  47.78 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  42.9 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2964  Beta-lactamase-like  48.73 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3052  beta-lactamase domain protein  48.73 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3160  beta-lactamase domain protein  48.1 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  36.47 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  42.63 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  42.08 
 
 		 321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  41.74 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  41.74 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  34.74 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  34.42 
 
 		 323 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  41.3 
 
 		 326 aa  155  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  41.3 
 
 		 323 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  40.87 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  33.77 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  38.63 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  35.19 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  35.37 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  32.42 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  32.86 
 
 		 309 aa  126  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  34.89 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  32.43 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  31.1 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  32.91 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  34.1 
 
 		 322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 		 308 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  32.69 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  31.5 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  33.94 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  34.39 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  29.66 
 
 		 337 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  31.97 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  31.98 
 
 		 305 aa  102  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  31.92 
 
 		 291 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  30.88 
 
 		 297 aa  99.8  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  33.67 
 
 		 301 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 		 297 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  27.2 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.07 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 		 267 aa  67  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  26.11 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  26.17 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  31.52 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  23.86 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 		 208 aa  58.9  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.99 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  24.25 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  23.83 
 
 		 213 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  28.89 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 210 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2946  beta-lactamase domain protein  25.6 
 
 		 263 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  24.33 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 211 aa  53.1  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 		 306 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  27.96 
 
 		 310 aa  52.8  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5043  Beta-lactamase-like  27.53 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  20.16 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.55 
 
 		 205 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  27.86 
 
 		 239 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1770  beta-lactamase domain protein  23.75 
 
 		 393 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 205 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 317 aa  50.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3054  metallo-beta-lactamase family protein  30.72 
 
 		 214 aa  49.7  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3552  beta-lactamase domain-containing protein  32.92 
 
 		 483 aa  49.7  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  31.14 
 
 		 205 aa  49.3  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  34.35 
 
 		 209 aa  49.3  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  28.74 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  26.59 
 
 		 200 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  31.79 
 
 		 212 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  29.58 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  31.18 
 
 		 215 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  27.05 
 
 		 207 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  24.79 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>