More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0436 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 306 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  93.79 
 
 		 306 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  78.69 
 
 		 306 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  56.49 
 
 		 314 aa  315  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  56.46 
 
 		 317 aa  314  9e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  54.48 
 
 		 319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  54.33 
 
 		 309 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0111  beta-lactamase domain protein  55.35 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  57.2 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  50.35 
 
 		 307 aa  279  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  52.76 
 
 		 309 aa  275  9e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  53.36 
 
 		 306 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  50.34 
 
 		 317 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  52.78 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  46.49 
 
 		 319 aa  252  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  49.24 
 
 		 306 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  55.14 
 
 		 308 aa  252  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  54.73 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  47.97 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  52.48 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  30.8 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 		 231 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.77 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.528285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  26.69 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  26.69 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  24.19 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  28.64 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  26.59 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  26.54 
 
 		 209 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  26.32 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  26.32 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  26.59 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  21.4 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  27.34 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  23.5 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  24.89 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  25.11 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  25.53 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  24.25 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3876  beta-lactamase domain protein  23.87 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  26.5 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20140  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.11 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  25.56 
 
 		 349 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  25.32 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  24.17 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.06 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  24.26 
 
 		 354 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  23.35 
 
 		 208 aa  55.5  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 		 400 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  23.7 
 
 		 407 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  25.44 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  30.92 
 
 		 407 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  28.83 
 
 		 209 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  24.58 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  23.9 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  26.55 
 
 		 213 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  33.64 
 
 		 228 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 		 298 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  21.82 
 
 		 396 aa  53.5  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  24.52 
 
 		 212 aa  53.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  25.53 
 
 		 354 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  26.35 
 
 		 399 aa  53.1  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  26.73 
 
 		 395 aa  53.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 293 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.52 
 
 		 259 aa  52.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  28.27 
 
 		 339 aa  52.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  25.35 
 
 		 287 aa  52.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  29.38 
 
 		 214 aa  52.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  27.2 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  29.52 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  32.61 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.99 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  34.09 
 
 		 267 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  27.43 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.53 
 
 		 255 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3168  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00770543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  23.21 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  25.6 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  26.18 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  24.04 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  27.71 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  24.05 
 
 		 862 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  26.74 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  26.52 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>