259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4770 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 309 aa  627  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0431  beta-lactamase domain-containing protein  56.11 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  57.24 
 
 		 308 aa  348  6e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  55.45 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0515  beta-lactamase domain-containing protein  58.47 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  55 
 
 		 306 aa  340  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  55.67 
 
 		 317 aa  340  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0531  beta-lactamase domain protein  57.81 
 
 		 308 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  52.1 
 
 		 319 aa  325  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  54.97 
 
 		 309 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0157  Beta-lactamase-like  52.09 
 
 		 314 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  57.43 
 
 		 306 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  57.2 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0583  beta-lactamase domain-containing protein  52.08 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266418 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 317 aa  278  6e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  53.18 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0258  putative beta lactamase protein  50.35 
 
 		 319 aa  268  7e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0111  beta-lactamase domain protein  49.68 
 
 		 317 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  41.47 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0756  beta-lactamase domain protein  43.15 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  29.66 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  34.74 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  28.33 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  23.98 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  26.2 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  31.32 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  29.71 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0311  beta-lactamase domain-containing protein  24.54 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000202771  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0329  beta-lactamase domain-containing protein  24.54 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000424657  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  24.41 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  27.42 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  27.04 
 
 		 211 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  24.65 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  24.41 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0269  Beta-lactamase-like  23.53 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120465  normal  0.961982 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 		 214 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  25.71 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  25.48 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09640  beta-lactamase domain protein  21.92 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  28.36 
 
 		 333 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  28.23 
 
 		 352 aa  53.1  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  25.76 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 212 aa  52.8  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  29.26 
 
 		 293 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0660  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000276126  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  30.34 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 		 207 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  25.59 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  24.69 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  26.43 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1480  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  28.24 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  32.5 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  28.72 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0521  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 		 258 aa  50.8  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000535463  hitchhiker  0.000000708931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 		 597 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.29 
 
 		 352 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0280  beta-lactamase-like protein  31.03 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.8 
 
 		 278 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  30.92 
 
 		 239 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  31.34 
 
 		 208 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5095  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 		 293 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.046641  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 		 444 aa  50.1  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  24.61 
 
 		 260 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.97 
 
 		 344 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  29.81 
 
 		 214 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  25.77 
 
 		 213 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  28.97 
 
 		 344 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  28.04 
 
 		 344 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2186  beta-lactamase domain protein  30.67 
 
 		 210 aa  49.7  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  22.56 
 
 		 246 aa  49.7  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.57 
 
 		 208 aa  49.7  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.34 
 
 		 222 aa  49.7  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  28.09 
 
 		 262 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  30.91 
 
 		 215 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  26.63 
 
 		 231 aa  49.3  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  30.43 
 
 		 216 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  25.59 
 
 		 295 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.71 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.71 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  28.34 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06350  uncharacterized flavoprotein  26.58 
 
 		 420 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.882044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.71 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.71 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  26.58 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.71 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  30.3 
 
 		 215 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  30.3 
 
 		 215 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  25.71 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  27.98 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>