195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0571 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0571  Zn-dependent hydrolase  100 
 
 		 260 aa  539  9.999999999999999e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0561  beta-lactamase-like  90.77 
 
 		 260 aa  497  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1835  beta-lactamase domain-containing protein  62.39 
 
 		 262 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128621  unclonable  0.000000000507933 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1562  beta-lactamase domain-containing protein  51.39 
 
 		 252 aa  271  8.000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.20369  hitchhiker  0.0000036598 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0286  metallo-beta-lactamase family protein  45.12 
 
 		 251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0623831  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3102  hypothetical protein  42.56 
 
 		 255 aa  208  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00137  metallo-beta-lactamase family protein  46.81 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.229532  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06736  zinc metallohydrolase  41.74 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000827  zn-dependent hydrolase  44.5 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000173508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3917  beta-lactamase-like  42.48 
 
 		 272 aa  202  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.575849  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.83 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0619  beta-lactamase domain-containing protein  26.19 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0890  beta-lactamase domain-containing protein  28.43 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  28.9 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0124  beta-lactamase domain protein  26.88 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  27.32 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  23.73 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  28.98 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  21.6 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  35.53 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  26.47 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  28.19 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  24.46 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  25.13 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2483  putative Beta-lactamase  26.75 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  24.31 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  24.79 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  24.39 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  36.78 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  24.37 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3408  Beta-lactamase  26.48 
 
 		 288 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126776  normal  0.0176052 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  23.14 
 
 		 317 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  27.61 
 
 		 317 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  31.58 
 
 		 294 aa  52.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  24.56 
 
 		 310 aa  52.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0161  beta-lactamase domain-containing protein  27.22 
 
 		 269 aa  52.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 324 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  23.98 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  22.73 
 
 		 318 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  24.75 
 
 		 310 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  25.35 
 
 		 323 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  26.99 
 
 		 317 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  25.42 
 
 		 317 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  20.83 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0673  beta-lactamase-like  23.85 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  26.29 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5001  beta-lactamase domain protein  36.89 
 
 		 350 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0521507  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  23.91 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1279  beta-lactamase domain protein  25.82 
 
 		 199 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  25.6 
 
 		 230 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  25.61 
 
 		 310 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  27.18 
 
 		 326 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  24.61 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  27.18 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  22.73 
 
 		 318 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  24.39 
 
 		 310 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  27.04 
 
 		 317 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  25 
 
 		 278 aa  49.3  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  26.38 
 
 		 317 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 310 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  26.38 
 
 		 317 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  27.04 
 
 		 317 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  28.91 
 
 		 327 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  28.08 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  23.11 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  25.97 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  24.27 
 
 		 296 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  25.81 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  23 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  22.49 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1494  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 		 307 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.321503  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  26.7 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  23.37 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  27.8 
 
 		 353 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  23.71 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1435  beta-lactamase domain-containing protein  29.37 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  29.37 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  25.79 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  26.7 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  26.87 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  26.7 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.29 
 
 		 352 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  24.15 
 
 		 319 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  24.19 
 
 		 329 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1277  beta-lactamase domain protein  32.79 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  29.84 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  29.84 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  23.11 
 
 		 310 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  26.61 
 
 		 301 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5069  beta-lactamase domain protein  22.41 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.137937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>