More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0989 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 249 aa  503  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  53.28 
 
 		 246 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  42.51 
 
 		 246 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  41.7 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  30.09 
 
 		 298 aa  106  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  26.87 
 
 		 312 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0116  beta-lactamase domain-containing protein  31.91 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000189379  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  31.46 
 
 		 309 aa  85.5  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  25.86 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  28.24 
 
 		 591 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  26.84 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1235  beta-lactamase-like  30.33 
 
 		 295 aa  82  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.643095  normal  0.0366717 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  29.03 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  28.49 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  26.21 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 		 444 aa  79  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  27.64 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  27.62 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  31.13 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0016  beta-lactamase domain protein  26.57 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000373362  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  24.41 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  28.02 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 		 319 aa  75.5  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  28.16 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  27.02 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  28.27 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  29.56 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  26.37 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  25.4 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  27.08 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  27.08 
 
 		 335 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.36 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  26.21 
 
 		 342 aa  72.4  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  29.61 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 		 308 aa  72  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  27.18 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  29.13 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  26.36 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  26.7 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  29.13 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.13 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  25.41 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  25.12 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  26.05 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  24.68 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4274  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.9 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0161  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0118  beta-lactamase domain protein  25.89 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.464415 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0436  beta-lactamase domain protein  26.4 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  26.21 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  29.2 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  24.55 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5378  beta-lactamase domain protein  24.55 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13255  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  26.21 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  27.09 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  26.21 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0121  beta-lactamase-like protein  24.88 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.381436  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  28.51 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  23.87 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  25.96 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  27.18 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0083  Beta-lactamase-like  26.83 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  22.43 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  24.11 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  25.12 
 
 		 321 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  26.46 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  26.34 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5095  beta-lactamase domain protein  23.87 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.046641  normal  0.029207 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  28.88 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  26.32 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  26.32 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  26.32 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  26.32 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  26.32 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  26.32 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  25.79 
 
 		 329 aa  65.5  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  26.32 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  25.6 
 
 		 316 aa  65.1  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>