269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1652 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 326 aa  673    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  57.47 
 
 		 333 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  47.3 
 
 		 315 aa  295  5e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  49.84 
 
 		 314 aa  287  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  43.81 
 
 		 637 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  40.99 
 
 		 644 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  39.94 
 
 		 342 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  34.44 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  33.45 
 
 		 313 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  30.99 
 
 		 308 aa  159  7e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  33.11 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  31.77 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  32.59 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  29.13 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  33.92 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  29.37 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  30.29 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  26.05 
 
 		 333 aa  99  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  29.26 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  27.23 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.97 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  27.53 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  29.31 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  28.24 
 
 		 290 aa  87  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  30.48 
 
 		 438 aa  86.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  29 
 
 		 337 aa  85.9  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  24.07 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  31.4 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  25.93 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  29.37 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  26.02 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  27.56 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  25.36 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  26.4 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  25.2 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  25.65 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  24.48 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  26.32 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  24.48 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  26.69 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  26.69 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  29.23 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  23.68 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  24.48 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  24.48 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  24.48 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  25.09 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  29.23 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  26.45 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  25.2 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  26 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  30.1 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  24.46 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  24.46 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  25.78 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  25.47 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  26.82 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  33.12 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  25.97 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  26.46 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  24.89 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  28.99 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  26.33 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  25.66 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  26.91 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  23.62 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  28.05 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  25.49 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  25.51 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1853  beta-lactamase domain-containing protein  23.59 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  22.47 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  30.21 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  24.56 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  22.86 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.45 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  25.71 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0016  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000373362  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  35 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  24.06 
 
 		 595 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  24.35 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>