223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1709 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  100 
 
 		 353 aa  728    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  38.48 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 		 319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  30.22 
 
 		 319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  31.46 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  31.66 
 
 		 319 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  32.43 
 
 		 319 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  32.43 
 
 		 319 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  31.27 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  30.84 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  31.27 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 		 264 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  29.6 
 
 		 319 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  30.89 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  33.46 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  31.66 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  31.66 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  31.27 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  31.27 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  31.66 
 
 		 318 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  31.66 
 
 		 318 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  31.66 
 
 		 318 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  31.66 
 
 		 318 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  31.66 
 
 		 318 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  31.66 
 
 		 318 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  31.66 
 
 		 318 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  31.03 
 
 		 319 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 299 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  31.66 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  31.87 
 
 		 321 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  26.72 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  30.45 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  29.23 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  27.07 
 
 		 318 aa  99.4  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  31.17 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 		 317 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  26.69 
 
 		 316 aa  96.3  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  29.73 
 
 		 319 aa  95.9  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.07 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  27.69 
 
 		 309 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  28.68 
 
 		 644 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  24.84 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  27.93 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  25.77 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 314 aa  90.5  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  24.59 
 
 		 316 aa  90.1  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  27.82 
 
 		 249 aa  89.7  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.51 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  27.2 
 
 		 287 aa  86.7  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  24.46 
 
 		 326 aa  85.9  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 321 aa  85.9  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  25.87 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  24.46 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  26.43 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  26.21 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  26.24 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  26.07 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  25.75 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  25.76 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  25.54 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  25.09 
 
 		 320 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  24.81 
 
 		 637 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  27.13 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  28.3 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 		 307 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  22.87 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  22.79 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  24.47 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  26.19 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  25.47 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  24.33 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  26.89 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  23.08 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  27.24 
 
 		 275 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  27.11 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  23.55 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  23.38 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  26.5 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  22.74 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  22.19 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  25.71 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  23.17 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  25.26 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  26.21 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  22.78 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  23.2 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>