More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0353 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  100 
 
 		 309 aa  629  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  52.73 
 
 		 310 aa  276  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  45.52 
 
 		 292 aa  251  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  42.07 
 
 		 292 aa  245  9e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  43.43 
 
 		 296 aa  239  5e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  41.64 
 
 		 294 aa  230  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  41.13 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  40.41 
 
 		 288 aa  229  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  41.43 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  39.43 
 
 		 291 aa  225  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  38.51 
 
 		 329 aa  209  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  37.02 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  34.64 
 
 		 294 aa  182  8.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  34.3 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  31.77 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  32.14 
 
 		 339 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  32.19 
 
 		 313 aa  135  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 319 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  32.21 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  29.93 
 
 		 298 aa  123  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  31.6 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  30.45 
 
 		 310 aa  106  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  31.93 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  29.74 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 		 264 aa  99.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  31.11 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  26.97 
 
 		 319 aa  99  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  30.08 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  30.08 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  30.08 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  30.08 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  31.22 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  30.08 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  30.08 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  30.08 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  31.49 
 
 		 319 aa  95.5  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  26.39 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  26.77 
 
 		 353 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  29.04 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 		 317 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  30.8 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  31.36 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.18 
 
 		 318 aa  92.4  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  27.81 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  29.67 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  28.26 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  28.02 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  25.56 
 
 		 332 aa  90.1  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  25.93 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  30.37 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  31.46 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  25.83 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  25 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  29.84 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  29.26 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  29.26 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  29.34 
 
 		 335 aa  86.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  29.34 
 
 		 335 aa  86.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  32.97 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  29.44 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.46 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.44 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  29 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  31.15 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  27.09 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  31.46 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.14 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  25.19 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  29.51 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.01 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  24.85 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  26.74 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 		 364 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  26.15 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  26.25 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  27.15 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  25.48 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  26.5 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  24.41 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>