More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1512 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 298 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  71.07 
 
 		 299 aa  431  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  66.2 
 
 		 302 aa  408  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  35 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  34.44 
 
 		 319 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  35 
 
 		 319 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  34.44 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  38.91 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  38.01 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  33.87 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  33.08 
 
 		 336 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  33.08 
 
 		 319 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  33.08 
 
 		 319 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  33.2 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  33.2 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  34.84 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  36.76 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  34.17 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  34.84 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  34.62 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  33.73 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  33.58 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 		 319 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  33.09 
 
 		 319 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  33.58 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  32.56 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  31.5 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  33.92 
 
 		 326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  34.52 
 
 		 315 aa  126  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  30.22 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  31.27 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  31.27 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  33.91 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  32.09 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  31.78 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  31.23 
 
 		 321 aa  122  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  30.92 
 
 		 438 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  32.93 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  35.42 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 264 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  32.47 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  33.19 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  30.49 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  29.58 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  29.2 
 
 		 318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  32.98 
 
 		 327 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  32.77 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  32.09 
 
 		 318 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  32.09 
 
 		 318 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  32.09 
 
 		 318 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  32.09 
 
 		 318 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  32.09 
 
 		 318 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  29.58 
 
 		 316 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  32.09 
 
 		 318 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  32.09 
 
 		 318 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  29.92 
 
 		 304 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  31.8 
 
 		 310 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 		 320 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  28.09 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  29.02 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  29.55 
 
 		 637 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33 
 
 		 319 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  30.96 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  31.39 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  30.31 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  27.61 
 
 		 362 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  27.56 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  29.34 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  27.65 
 
 		 329 aa  106  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  33.68 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  32.22 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 		 249 aa  105  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  30.8 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 		 318 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  31.08 
 
 		 315 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  29.8 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  30.2 
 
 		 644 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  30.13 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  30.17 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  26.88 
 
 		 289 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  32.67 
 
 		 364 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  28.14 
 
 		 312 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  31.02 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  31.35 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  27.01 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  29.96 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  34.16 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  30.05 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>