245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4537 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
314 aa  630  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  57.69 
 
 
333 aa  332  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  49.84 
 
 
326 aa  287  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  46.65 
 
 
637 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  46.18 
 
 
644 aa  249  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  47.22 
 
 
315 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  45.45 
 
 
342 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  32.64 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  33.22 
 
 
304 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  31.83 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  33.72 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  31.99 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  32.29 
 
 
299 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  30.33 
 
 
302 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  29.49 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  35.06 
 
 
342 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 
305 aa  99.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  31.67 
 
 
287 aa  95.5  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
318 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  29.07 
 
 
315 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 
317 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  28.84 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  32.13 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  29.62 
 
 
264 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  27.66 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  32.42 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  28.05 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  27.94 
 
 
316 aa  86.3  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.52 
 
 
318 aa  85.9  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  29.6 
 
 
327 aa  85.9  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  29.01 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.51 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  29.01 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  32.79 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  27.66 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  28.74 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  28.08 
 
 
352 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  29.2 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  31.17 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  29.63 
 
 
316 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 
438 aa  82.4  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  27.47 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  28.2 
 
 
319 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  29.36 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  30.84 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  27.7 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  27.7 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  29.91 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  28.52 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  26.79 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  30.26 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  23.66 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  28.16 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 
316 aa  79  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  29.91 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  27.17 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  25.62 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  33.19 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  26.52 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  26.42 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  25.09 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  26.42 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  24.75 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  27.37 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  26.55 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  26.55 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  26.55 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  26.55 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  26.55 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  26.55 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  26.55 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  25.32 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  25.99 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  28.21 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  24.11 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  26.83 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  26.64 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  20.96 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  30.56 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>