279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1344 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 311 aa  616  1e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  46.03 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  45.24 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  45.45 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  43.62 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  42.14 
 
 		 310 aa  205  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  39.74 
 
 		 319 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  34.44 
 
 		 326 aa  169  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  35.25 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  31.02 
 
 		 308 aa  159  7e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  35.76 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  36.45 
 
 		 637 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  35.52 
 
 		 644 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  31.83 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  33.99 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  32.71 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  30.13 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  31.3 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  28.86 
 
 		 321 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  27.73 
 
 		 333 aa  89.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  29.61 
 
 		 288 aa  89.4  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  30.93 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  30.68 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  32.77 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  31.44 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  29.63 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  28.21 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  30.54 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  29.62 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  26.34 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  30.29 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  29.97 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  28.28 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  28.5 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  31.3 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  27.67 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  27.42 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.98 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  30.09 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  30.09 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  28.65 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.12 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  22.6 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  25.23 
 
 		 353 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  26.6 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  26.6 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  26.6 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  26.6 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  26.6 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  26.6 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  27.27 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  25.84 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  31.61 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  26.6 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  26.79 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  28.66 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  28.07 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  32.8 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  28.34 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  30.66 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  35.19 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  29.57 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  26.6 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  23.89 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  24.88 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  24.88 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  25.85 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  27.39 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  24.8 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  28.49 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  24.91 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  33.56 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  24.29 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>