227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1646 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 292 aa  592  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  62.36 
 
 		 291 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  63.06 
 
 		 287 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  60.69 
 
 		 288 aa  361  8e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  60.75 
 
 		 289 aa  359  3e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  62.41 
 
 		 294 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  53.98 
 
 		 292 aa  318  6e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  51.54 
 
 		 296 aa  310  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  42.07 
 
 		 309 aa  245  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  47.92 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  40 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  37.41 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  37.09 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  32.35 
 
 		 318 aa  148  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  38.03 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  31.54 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  33.06 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  31.03 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  30.92 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  32.37 
 
 		 313 aa  115  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  29.8 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  29.31 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  26.32 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  30.9 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  26.29 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  25.29 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  26.51 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  26.36 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  26.51 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  25.51 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  23.41 
 
 		 331 aa  68.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  23.66 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  27.37 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  24.85 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  25.55 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  25.55 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  25.55 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  25.55 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  25.55 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  25.55 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  25.55 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  24.64 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  26.34 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  26.34 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  22.55 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  23.4 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  25.45 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  27.22 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  24.36 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  23.67 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  25.43 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  24.78 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  22.57 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  22.96 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  22.96 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  27.23 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  23.67 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  22.07 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  24.24 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  24.29 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  24.24 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  25.54 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  26.26 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  23.74 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  25.12 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  25.67 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  24.78 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  25.76 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  25.95 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  25.26 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  25.7 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  24.44 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  24.79 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.12 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  24.21 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  23.45 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  26.07 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  23.25 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  24.88 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1178  Beta-lactamase  23.04 
 
 		 238 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.188267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.23 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  26.13 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  27 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>