249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1827 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 291 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  74.56 
 
 		 287 aa  443  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  62.18 
 
 		 292 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  61.05 
 
 		 289 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  60.97 
 
 		 294 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  58.12 
 
 		 288 aa  352  5e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  48.78 
 
 		 296 aa  296  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  48.95 
 
 		 292 aa  291  8e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  38.87 
 
 		 309 aa  227  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  44.15 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  36.94 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  34.85 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  32.89 
 
 		 329 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  31.23 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  32.26 
 
 		 339 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  33.76 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  32.3 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  27.94 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 313 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  28.18 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 		 302 aa  99.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  32.98 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  31.02 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  29.41 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  25.83 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  27.47 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  30.21 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  26.22 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  24.91 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  26.22 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  26.22 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  27.51 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  26.22 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  26.22 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  26.22 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  26.22 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  26.85 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  23.93 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  25.11 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  27.16 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  25.22 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  25.96 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  26.52 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  26.64 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  26.64 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  26.99 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  26.99 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  26.67 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  25.53 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  25.77 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  24.45 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.52 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  26.11 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  25.75 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  26.2 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  26.29 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  23.68 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  28.5 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  25.81 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  25.68 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1898  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.337278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.84 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  26.42 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  25.78 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  25.78 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  23.55 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  26.03 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.9 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  24.05 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  30.65 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  26.11 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  24.5 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  25.54 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  24.68 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  26.73 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  27.86 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  24.65 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  25.41 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  30.46 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  25.21 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  24.78 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  24.7 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1117  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>