276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2305 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
314 aa  642    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  46.3 
 
 
349 aa  278  7e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  46.27 
 
 
327 aa  278  9e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  46.31 
 
 
315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  45.58 
 
 
315 aa  245  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  43.77 
 
 
321 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  41.91 
 
 
320 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  41.5 
 
 
352 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  41.64 
 
 
310 aa  236  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  41.31 
 
 
310 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  41.31 
 
 
310 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  40.19 
 
 
308 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  39.26 
 
 
346 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  40.92 
 
 
315 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  41.2 
 
 
351 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  37.37 
 
 
364 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  37.19 
 
 
364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  35.21 
 
 
347 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  35.79 
 
 
342 aa  155  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  34.04 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  31.73 
 
 
323 aa  145  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  35.09 
 
 
313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 
325 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  34.84 
 
 
309 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  34.39 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 
307 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  29.8 
 
 
323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 
334 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 
315 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 
315 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  30.6 
 
 
351 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  32.86 
 
 
597 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  31.86 
 
 
312 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 
321 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  30.14 
 
 
298 aa  122  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 
342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  31.44 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 
309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
317 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
302 aa  109  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  29.72 
 
 
287 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  29.51 
 
 
318 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  29.93 
 
 
318 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  29.34 
 
 
298 aa  106  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  28.25 
 
 
318 aa  105  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 
318 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  33.16 
 
 
299 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 
337 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  30.22 
 
 
315 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 
312 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  27.06 
 
 
333 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  31.84 
 
 
334 aa  96.3  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  25.34 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  28.32 
 
 
312 aa  92.4  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.97 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  33.66 
 
 
271 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  31.2 
 
 
295 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  26.3 
 
 
318 aa  89.4  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  28.27 
 
 
319 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 
308 aa  87.8  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  26.84 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
272 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  27.97 
 
 
319 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 
271 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 
343 aa  86.3  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 
275 aa  85.9  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  28.39 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  25.7 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  25.49 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  25.3 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  28.96 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  26.8 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  28.67 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  29.6 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  31.36 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  27.12 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  25.94 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  25.94 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  27.12 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  26.69 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  26.27 
 
 
339 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  25.82 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  28.27 
 
 
335 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  28.27 
 
 
335 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  31.31 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  27.62 
 
 
637 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  27.54 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  25.28 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>