228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6778 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6778  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 310 aa  630  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.889748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  52.73 
 
 		 309 aa  278  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1415  beta-lactamase-like protein  42.26 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0489899 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  47.92 
 
 		 292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  43.82 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2384  beta-lactamase domain-containing protein  43.4 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  43.07 
 
 		 296 aa  230  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2195  beta-lactamase-like protein  42.64 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  44.15 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2823  beta-lactamase domain-containing protein  43.64 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.328939  normal  0.0927352 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  44.27 
 
 		 329 aa  202  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  39.2 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  36 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  32.21 
 
 		 318 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  32.3 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  30.64 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2674  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1553  beta-lactamase domain protein  33.6 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163514  hitchhiker  0.000581399 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  34.17 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  28.23 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2395  beta-lactamase domain-containing protein  27.89 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  29.18 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  29.88 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  29.06 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  32.04 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  31.14 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  26.98 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  30.23 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 		 246 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  27.47 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  26.19 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  26.19 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  26.19 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  26.19 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  26.19 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  26.19 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  26.19 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  25.9 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  28.2 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  26.48 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  25.7 
 
 		 644 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2197  beta-lactamase domain-containing protein  26.2 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0276351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  29.09 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  27.93 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  35.19 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  26.5 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  26.69 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  28.11 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  24.27 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  25.59 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  29.14 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  24.19 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  25.98 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  24.12 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  24.88 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  24.8 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  23.83 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  25.7 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  26.96 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  26.96 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  27.69 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  27.64 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  23.05 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25.24 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  22.73 
 
 		 637 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  25.93 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  24.5 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.57 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.64 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  25.21 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  28.89 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  24.02 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  25.64 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  24.76 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  24.76 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  27.13 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  24.76 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  26.7 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  27.15 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  28.4 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  27.92 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  27.23 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  24.76 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1853  beta-lactamase domain-containing protein  21.94 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2077  beta-lactamase domain-containing protein  25.2 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  22.53 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>